RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373115.4

CHST3-201, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHST3, Length 6,970 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3-201ENST00000373115 UROSP10746 265 aa15.5■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 HTR1BP28222 390 aa15.5■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 CASP9P55211 416 aa15.5■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 XIAPP98170 497 aa15.5■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 FAM83AQ86UY5 434 aa15.5■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 ANKRD46Q86W74 232 aa15.5■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.5■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 DNAJC11Q9NVH1 559 aa15.5■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 MAFFQ9ULX9 164 aa15.5■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 USP31Q70CQ4 1352 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 ELOVL7A1L3X0 281 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 PAGE1O75459 146 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 ALAS2P22557 587 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 PPIBP23284 216 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 CDK18Q07002 472 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 SLC1A5Q15758 541 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 IDNKQ5T6J7 187 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 LRRC38Q5VT99 294 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 ZFPM1Q8IX07 1006 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 MYO19Q96H55 970 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 FADS2P1A8MWK0 482 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 DHX15O43143 795 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 DCST1Q5T197 706 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 KCTD8Q6ZWB6 473 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 MAB21L3Q8N8X9 362 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 SPERTQ8NA61 448 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 PMEPA1Q969W9 287 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 PNPLA8Q9NP80 782 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 NOMO3P69849 1222 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 IL17AQ16552 155 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 ZNF697Q5TEC3 545 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 CXCL17Q6UXB2 119 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 CDCA5Q96FF9 252 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 FEM1AQ9BSK4 669 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 B3GNT5Q9BYG0 378 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 MLXQ9UH92 298 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 QSOX1O00391 747 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 PLK4O00444 970 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 GJA8P48165 433 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 SP140Q13342 867 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 ZZZ3Q8IYH5 903 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 UROC1Q96N76 676 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 TESMINQ9Y4I5 508 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 AIREO43918 545 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 PSKH1P11801 424 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 GHDCQ8N2G8 530 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 JOSD2Q8TAC2 188 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 SPOCK2Q92563 424 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 COPS8Q99627 209 aa15.49■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 TEX46H3BTG2 121 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 DDNO94850 711 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 C17orf64Q86WR6 236 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 KAZALD1Q96I82 304 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 A0A1W2PQH9 124 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 C22orf31O95567 290 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 PSMD5Q16401 504 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 PIK3R3Q92569 461 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 FAM84AQ96KN4 292 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 HSFY1Q96LI6 401 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 PLEKHA1Q9HB21 404 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 TMEM27Q9HBJ8 222 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 RIIAD1A6NNX1 92 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 BTNL10A8MVZ5 291 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 CABYRO75952 493 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 MPP1Q00013 466 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 HSPB3Q12988 150 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 PRDM4Q9UKN5 801 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 ALOX15BO15296 676 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 SLC20A2Q08357 652 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 CBR4Q8N4T8 237 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 TBC1D3EA0A087X179 549 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 TBC1D3LB9A6J9 549 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 KMOO15229 486 aa15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 IPO13O94829 963 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CHST3-201ENST00000373115 KDM4BO94953 1096 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms