RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 GPR141Q7Z602 305 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 EPHX4Q8IUS5 362 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC15A3Q8IY34 581 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 WBP2Q969T9 261 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 CREBZFQ9NS37 354 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 ACTR3BQ9P1U1 418 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 MED16Q9Y2X0 877 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC14BA6NHZ5 514 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP6CO00743 305 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 INSIG1O15503 277 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 HOXA2O43364 376 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 STC2O76061 302 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 EFEMP2O95967 443 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 MTHFD2P13995 350 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 NUP107P57740 925 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATS1Q496A3 300 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 SPPL2CQ8IUH8 684 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 OR4K2Q8NGD2 314 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 RMDN1Q96DB5 314 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 ADI1Q9BV57 179 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 IL1RL2Q9HB29 575 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 GID8Q9NWU2 228 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM64A6NGJ6 449 aa23.7■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 UBXN8O00124 270 aa23.7■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 CLDN11O75508 207 aa23.7■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 CDK14O94921 469 aa23.7■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 MATN4O95460 622 aa23.7■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 C7P10643 843 aa23.7■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 CAPN3P20807 821 aa23.7■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 FASP25445 335 aa23.7■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 ZBED5Q49AG3 693 aa23.7■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 VPS26BQ4G0F5 336 aa23.7■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 TWIST2Q8WVJ9 160 aa23.7■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 CAPNS2Q96L46 248 aa23.7■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 C9orf16Q9BUW7 83 aa23.7■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 POPDC3Q9HBV1 291 aa23.7■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 C8orf4Q9NR00 106 aa23.7■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 GBF1Q92538 1859 aa23.7■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 FXYD1O00168 92 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 GNAO1P09471 354 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 TUFMP49411 452 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 MERTKQ12866 999 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 COQ5Q5HYK3 327 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC43Q8N309 656 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF786Q8N393 782 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 ATOH8Q96SQ7 321 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 RETREG1Q9H6L5 497 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 PITPNM1O00562 1244 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 AZIN1O14977 448 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 PIP5K1BO14986 540 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 TSPAN3O60637 253 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 RHOCP08134 193 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 GALK1P51570 392 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 FOXM1Q08050 763 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 KANK2Q63ZY3 851 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 PDZD8Q8NEN9 1154 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 MYRFLQ96LU7 910 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP2S1Q96SQ9 504 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 RNF38Q9H0F5 515 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 MID1IP1Q9NPA3 183 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 CMTM6Q9NX76 183 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 ILVBLA1L0T0 632 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 CBX4O00257 560 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 F11P03951 625 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC6A2P23975 617 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP6AP1Q15904 470 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 PFKFB4Q16877 469 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC36A3Q495N2 470 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 CROCCP3Q8IVE0 287 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 OVCA2Q8WZ82 227 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 PLD4Q96BZ4 506 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 SCUBE2Q9NQ36 999 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 EGFL7Q9UHF1 273 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 IKZF3Q9UKT9 509 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM50BQ9Y247 325 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 IRF1P10914 325 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 FMO4P31512 558 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 CCT8P50990 548 aa23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms