RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 TBC1D3HP0C7X1 549 aa17.61■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 CRABP2P29373 138 aa17.61■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 GPR1P46091 355 aa17.61■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 CSRP3P50461 194 aa17.61■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 PPP2CBP62714 309 aa17.61■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 PPP2CAP67775 309 aa17.61■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa17.61■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa17.61■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 PLA2G15Q8NCC3 412 aa17.61■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 FAM131CQ96AQ9 280 aa17.61■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 GPR21Q99679 349 aa17.61■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 MYOCQ99972 504 aa17.61■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 GPAMQ9HCL2 828 aa17.61■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 EBF1Q9UH73 591 aa17.61■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 FZD4Q9ULV1 537 aa17.61■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 MED16Q9Y2X0 877 aa17.61■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 GLRA3O75311 464 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 SOD1P00441 154 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 ESR1P03372 595 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 ACSL1P33121 698 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 CRHR1P34998 444 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 GLRBP48167 497 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 POLD2P49005 469 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 WDR4P57081 412 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 DLG1Q12959 904 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 FGL2Q14314 439 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 LVRNQ6Q4G3 990 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 USP30Q70CQ3 517 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 ZNF765Q7L2R6 523 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 KBTBD6Q86V97 674 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 PJA1Q8NG27 643 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 DENND1AQ8TEH3 1009 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 GLYATL1Q969I3 302 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 SLC30A3Q99726 388 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 SMOXQ9NWM0 555 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 MKS1Q9NXB0 559 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 ADAM21Q9UKJ8 722 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 CYP8B1Q9UNU6 501 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 ACOT9Q9Y305 439 aa17.6■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 E5RI56 91 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 ATG13O75143 517 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 VPS26AO75436 327 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 ZWINTO95229 277 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 DCNP07585 359 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 CHRM3P20309 590 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 MDH1P40925 334 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 CCT5P48643 541 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 PXNP49023 591 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 ITIH4Q14624 930 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 WSCD2Q2TBF2 565 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 HHATQ5VTY9 493 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 TMEM207Q6UWW9 146 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 CLEC14AQ86T13 490 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 ARMC2Q8NEN0 867 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 BTN2A2Q8WVV5 523 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 DYDC1Q8WWB3 177 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 DCUN1D1Q96GG9 259 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 CABS1Q96KC9 395 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 NELL2Q99435 816 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 TPSD1Q9BZJ3 242 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 TMEM216Q9P0N5 145 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 GNPTGQ9UJJ9 305 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 EMCNQ9ULC0 261 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 PLLPQ9Y342 182 aa17.59■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 A0A087X1B8 175 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 WDR91A4D1P6 747 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 TRIM16O95361 564 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 MSH3P20585 1137 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 RPS21P63220 83 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 CREB5Q02930 508 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 CSHL1Q14406 222 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 IRF4Q15306 451 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 NAPRTQ6XQN6 538 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 CCDC63Q8NA47 563 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 DDHD1Q8NEL9 900 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 GIMAP7Q8NHV1 300 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD49Q8WVL7 239 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 NXNL1Q96CM4 212 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 TSNARE1Q96NA8 513 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 FZD3Q9NPG1 666 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 TAS2R13Q9NYV9 303 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 GRID1Q9ULK0 1009 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa17.58■□□□□ 0.41
LTV1-201ENST00000367576 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa17.58■□□□□ 0.4
LTV1-201ENST00000367576 TM9SF1O15321 606 aa17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms