RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 FGBP02675 491 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 HIST1H2ABP04908 130 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 HIST1H2ADP20671 130 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 HOXC9P31274 260 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ENTPD1P49961 510 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 NPY4RP50391 375 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 NUDT6P53370 316 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TFAP4Q01664 338 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 RUNX1T1Q06455 604 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRT33BQ14525 404 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CTF1Q16619 201 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MEP1AQ16819 746 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRT24Q2M2I5 525 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 KLHL26Q53HC5 615 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 FSCBQ5H9T9 825 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRT79Q5XKE5 535 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 NCAPH2Q6IBW4 605 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNAJC10Q8IXB1 793 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PGBD5Q8N414 524 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRR26Q8N8Z3 221 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPATA22Q8NHS9 363 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBC1D16Q8TBP0 767 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM163Q8TC26 289 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 WASF1Q92558 559 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF778Q96MU6 729 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 NUDCD1Q96RS6 583 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CSTL1Q9H114 145 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TASP1Q9H6P5 420 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 OCIAD1Q9NX40 245 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 C1RLQ9NZP8 487 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 RHCGQ9UBD6 479 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNF150Q9ULK6 438 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SNX9Q9Y5X1 595 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 KANSL1LA0AUZ9 987 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 GAGE12JA6NER3 117 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANKRD28O15084 1053 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC7A4O43246 635 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPINT2O43291 252 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 DAB1O75553 588 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CSPG5O95196 566 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TGDSO95455 350 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARRB2P32121 409 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 STX2P32856 288 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 LMAN1P49257 510 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCYT1AP49585 367 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 RASSF2P50749 326 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 FOXM1Q08050 763 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MZT1Q08AG7 82 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ST3GAL1Q11201 340 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRKAA1Q13131 559 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PSMD6Q15008 389 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SNAPC1Q16533 368 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 LEXMQ3ZCV2 418 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 AMZ1Q400G9 498 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRTCAP3Q53RY4 240 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 DCST1Q5T197 706 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 C18orf63Q68DL7 685 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 LCN10Q6JVE6 187 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 FIGLAQ6QHK4 219 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MFSD6Q6ZSS7 791 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 FJX1Q86VR8 437 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 IQCHQ86VS3 1027 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SNX32Q86XE0 403 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM114A1Q8IWE2 563 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PELI3Q8N2H9 469 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TTC30BQ8N4P2 665 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 AFAP1Q8N556 730 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-487P-201ENST00000365430 NKAIN3Q8N8D7 197 aa2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms