RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356253.9

CACNA2D1-201, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CACNA2D1, Length 3,858 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-201ENST00000356253 HAUS8Q9BT25 410 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 SCAMP1O15126 338 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 AOC1P19801 751 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 HNF4AP41235 474 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 IL23RQ5VWK5 629 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 ERAP2Q6P179 960 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 PDP2Q9P2J9 529 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 G3V2L1 256 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 RGS14O43566 566 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 NPHS1O60500 1241 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 SLC22A3O75751 556 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 STC1P52823 247 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 AQP4P55087 323 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 HMGCS1Q01581 520 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 CACNG1Q06432 222 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 SPDYE7PQ495Y7 208 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 ZFP1Q6P2D0 407 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 CCDC28BQ9BUN5 200 aa14.6□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 ARHGAP10A1A4S6 786 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 IMPDH1P20839 514 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 KCNA5P22460 613 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 SLC6A4P31645 630 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 S100A3P33764 101 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 RGRP47804 291 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 FOLH1Q04609 750 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 ZNF33AQ06730 810 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 PDK3Q15120 406 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 CHRNA6Q15825 494 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 RNF220Q5VTB9 566 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 PXYLP1Q8TE99 480 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 TEX28O15482 410 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 SNNO75324 88 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 S1PR4O95977 384 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 OTCP00480 354 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 GABRB3P28472 473 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 ALDH9A1P49189 494 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 HERVK_113P63132 956 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 DSC3Q14574 896 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 MBTPS1Q14703 1052 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 RAET1GQ6H3X3 334 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 ANKRD46Q86W74 232 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 PSKH2Q96QS6 385 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 ERVK-6Q9BXR3 956 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 PCDH12Q9NPG4 1184 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 E7ENX8 843 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 JUNP05412 331 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 SPAM1P38567 509 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 IRF5Q13568 498 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 C6orf52Q5T4I8 152 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 CHST9Q7L1S5 443 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 C11orf74Q86VG3 221 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 MYLIPQ8WY64 445 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 APOLD1Q96LR9 279 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 CCDC106Q9BWC9 280 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 EBF3Q9H4W6 596 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 INVSQ9Y283 1065 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.59□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 CLTBP09497 229 aa14.58□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.58□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 CDC16Q13042 620 aa14.58□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.58□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.58□□□□□ -0.07
CACNA2D1-201ENST00000356253 PPP6CO00743 305 aa14.58□□□□□ -0.08
CACNA2D1-201ENST00000356253 RFPL2O75678 378 aa14.58□□□□□ -0.08
CACNA2D1-201ENST00000356253 FGF18O76093 207 aa14.58□□□□□ -0.08
CACNA2D1-201ENST00000356253 FGBP02675 491 aa14.58□□□□□ -0.08
CACNA2D1-201ENST00000356253 SOD2P04179 222 aa14.58□□□□□ -0.08
CACNA2D1-201ENST00000356253 IDO1P14902 403 aa14.58□□□□□ -0.08
CACNA2D1-201ENST00000356253 GM2AP17900 193 aa14.58□□□□□ -0.08
CACNA2D1-201ENST00000356253 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CACNA2D1-201ENST00000356253 MAPK8P45983 427 aa14.58□□□□□ -0.08
CACNA2D1-201ENST00000356253 RPIAP49247 311 aa14.58□□□□□ -0.08
CACNA2D1-201ENST00000356253 TMED1Q13445 227 aa14.58□□□□□ -0.08
CACNA2D1-201ENST00000356253 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa14.58□□□□□ -0.08
CACNA2D1-201ENST00000356253 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CACNA2D1-201ENST00000356253 CYS1Q717R9 158 aa14.58□□□□□ -0.08
CACNA2D1-201ENST00000356253 SYT12Q8IV01 421 aa14.58□□□□□ -0.08
CACNA2D1-201ENST00000356253 ITFG1Q8TB96 612 aa14.58□□□□□ -0.08
CACNA2D1-201ENST00000356253 SORT1Q99523 831 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms