RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP17.73■□□□□ 0.432e-13■■■□□ 16.6
ACTB-201ENST00000331789 CDYLQ9Y232 598 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa17.73■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 CCDC189A1A4V9 331 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 LEFTY1O75610 366 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 C1SP09871 688 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 GFAPP14136 432 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP17.72■□□□□ 0.432e-30■■■□□ 14.8
ACTB-201ENST00000331789 FSHRP23945 695 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 METTL21CQ5VZV1 264 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 ACAD11Q709F0 780 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 RBFAQ8N0V3 343 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 CLDN19Q8N6F1 224 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 FAM13CQ8NE31 585 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 BPIFB1Q8TDL5 484 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 FGF13Q92913 245 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 ASB16Q96NS5 453 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 DHRS7Q9Y394 339 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 RFXAPO00287 272 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 PPP6CO00743 305 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 TULP3O75386 442 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 PAPLNO95428 1278 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 ADH1CP00326 375 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 CTSLP07711 333 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 NNMTP40261 264 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 RIPK1Q13546 671 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 SNCBQ16143 134 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 FBXO48Q5FWF7 155 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 NXNQ6DKJ4 435 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 UGT3A1Q6NUS8 523 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 SMARCD2Q92925 531 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 PBXIP1Q96AQ6 731 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 TTC1Q99614 292 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 CCDC28BQ9BUN5 200 aa17.72■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 SDHDO14521 159 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 CD1EP15812 388 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 PTPN5P54829 565 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 BTKQ06187 659 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 KLF10Q13118 480 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 GPR33Q49SQ1 333 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 TMEM198Q66K66 360 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 NXPE1Q8N323 547 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 FBXO39Q8N4B4 442 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 NXPE3Q969Y0 559 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 ABCG8Q9H221 673 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 GNPTGQ9UJJ9 305 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 TRAF6Q9Y4K3 522 aa17.71■□□□□ 0.43
ACTB-201ENST00000331789 TRPC5OSA6NMA1 111 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 HEPACAM2A8MVW5 462 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 MEI4A8MW99 385 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 TRIM16O95361 564 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 HK3P52790 923 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 NAA25Q14CX7 972 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 PPP2R2DQ66LE6 453 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 CLEC6AQ6EIG7 209 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 TMPRSS6Q8IU80 811 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 CATSPER2Q96P56 530 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 TRMOQ9BU70 441 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 CD84Q9UIB8 345 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 LOC100653049A0A140TA62 436 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PQ67 120 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 KRT34O76011 436 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 TIMP2P16035 220 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 SH3BP2P78314 561 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 MXRA7P84157 204 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 GAB4Q2WGN9 574 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 POM121L1PQ3SYA9 428 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 BRAT1Q6PJG6 821 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 STON2Q8WXE9 905 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 FAR2Q96K12 515 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 MARK4Q96L34 752 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 LMAN2LQ9H0V9 348 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 IL36AQ9UHA7 158 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 SLC8A2Q9UPR5 921 aa17.7■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 SYCE1LA8MT33 242 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 AGAP14A8MT82 685 aa17.69■□□□□ 0.42
ACTB-201ENST00000331789 PRRT4C9JH25 899 aa17.69■□□□□ 0.42
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