RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322344.7

PNKP-201, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PNKP, Length 2,041 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-201ENST00000322344 ZNF461Q8TAF7 563 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 SMIM14Q96QK8 99 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 OSBPL11Q9BXB4 747 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 TRIM4Q9C037 500 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 MUC13Q9H3R2 512 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 RIC8BQ9NVN3 520 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 NUDT4Q9NZJ9 180 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 LHX3Q9UBR4 397 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 SNX13Q9Y5W8 968 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
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PNKP-201ENST00000322344 CHRM3P20309 590 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 CREB5Q02930 508 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 CACNG1Q06432 222 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 IKBKEQ14164 716 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 INPP5AQ14642 412 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 RBBP7Q16576 425 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 SLC15A3Q8IY34 581 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 ANKFN1Q8N957 763 aa22.16■■□□□ 1.14
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PNKP-201ENST00000322344 LRRC58Q96CX6 371 aa22.16■■□□□ 1.14
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PNKP-201ENST00000322344 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 TRIM54Q9BYV2 358 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 RNF38Q9H0F5 515 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 COQ10BQ9H8M1 238 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 CD274Q9NZQ7 290 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 PKP3Q9Y446 797 aa22.16■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 A0A1B0GTL3 188 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 A0A1W2PP18 115 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 FXYD1O00168 92 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 ABLIM3O94929 683 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 GSTT1P30711 240 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 KCNK10P57789 538 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
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PNKP-201ENST00000322344 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 ZNF382Q96SR6 550 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 BPIFA1Q9NP55 256 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 SLC52A3Q9NQ40 469 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 PADI4Q9UM07 663 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 LZTS1Q9Y250 596 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 TIMM22Q9Y584 194 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa22.15■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
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PNKP-201ENST00000322344 H0Y626 953 aa22.14■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 FZD6O60353 706 aa22.14■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 SNAP91O60641 907 aa22.14■■□□□ 1.14
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PNKP-201ENST00000322344 CLPTM1O96005 669 aa22.14■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 ATP6V1B2P21281 511 aa22.14■■□□□ 1.14
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PNKP-201ENST00000322344 CERS6Q6ZMG9 384 aa22.14■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 TAS2R42Q7RTR8 314 aa22.14■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.14■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 BRINP2Q9C0B6 783 aa22.14■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 P2RY12Q9H244 342 aa22.14■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa22.14■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 IL1RL2Q9HB29 575 aa22.14■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 IL17CQ9P0M4 197 aa22.14■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 YIPF1Q9Y548 306 aa22.14■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa22.14■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa22.14■■□□□ 1.14
PNKP-201ENST00000322344 ZNF839A8K0R7 811 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 BMP2P12643 396 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 PSMC3P17980 439 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 GRIA3P42263 894 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 HK3P52790 923 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 RHOAP61586 193 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 MYBPC1Q00872 1141 aa22.14■■□□□ 1.13
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PNKP-201ENST00000322344 LINGO4Q6UY18 593 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 CPNE9Q8IYJ1 553 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 IGSF21Q96ID5 467 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 MAGEE1Q9HCI5 957 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 ACTR3BQ9P1U1 418 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 ZNF711Q9Y462 761 aa22.14■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 CSPG5O95196 566 aa22.13■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 SLC6A2P23975 617 aa22.13■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 DIO3P55073 304 aa22.13■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 ERVK-8P63133 956 aa22.13■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 ECT2LQ008S8 904 aa22.13■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 TWF1Q12792 350 aa22.13■■□□□ 1.13
PNKP-201ENST00000322344 MTX3Q5HYI7 312 aa22.13■■□□□ 1.13
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