RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 OR10H2O60403 315 aa21.09■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 GATMP50440 423 aa21.09■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 FAM182AQ5T1J6 154 aa21.09■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 ZNF781Q8N8C0 355 aa21.09■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 PEBP4Q96S96 227 aa21.09■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 RNF186Q9NXI6 227 aa21.09■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 DHRS12A0PJE2 317 aa21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP21.08■□□□□ 0.971e-6■■■□□ 18.9
LRP5-201ENST00000294304 SYN1P17600 705 aa21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 TCEAL1Q15170 157 aa21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 SPESP1Q6UW49 350 aa21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 FLCNQ8NFG4 579 aa21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 DYTNA2CJ06 578 aa21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 CNMDO75829 334 aa21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 PPIBP23284 216 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 LPCAT2Q7L5N7 544 aa21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 C16orf62Q7Z3J2 963 aa21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 FITM2Q8N6M3 262 aa21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 CCNDBP1O95273 360 aa21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 ECT2LQ008S8 904 aa21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 SF1Q15637 639 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 NEDD8Q15843 81 aa21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 CPTPQ5TA50 214 aa21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 ZNF605Q86T29 641 aa21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 GATAD2AQ86YP4 633 aa21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 DTNBP1Q96EV8 351 aa21.08■□□□□ 0.97
LRP5-201ENST00000294304 GSC2O15499 205 aa21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 PAICSP22234 425 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 CCR3P51677 355 aa21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 CYP4F2P78329 520 aa21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 GTF2H2Q13888 395 aa21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 GALNT13Q8IUC8 556 aa21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 SH3GL3Q99963 347 aa21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 ZNF623O75123 536 aa21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 TRBC1P01850 177 aa21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 VAV1P15498 845 aa21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 GALNT2Q10471 571 aa21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 GPAT3Q53EU6 434 aa21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 LRRC73Q5JTD7 316 aa21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 RORBQ92753 470 aa21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 MYH1P12882 1939 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 UROSP10746 265 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 SEMG2Q02383 582 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 TTC23Q5W5X9 447 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 SULT1C3Q6IMI6 304 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 TMEM220Q6QAJ8 160 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 DPP10Q8N608 796 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 PQLC3Q8N755 202 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 PHC3Q8NDX5 983 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 VMP1Q96GC9 406 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 SUV39H2Q9H5I1 410 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 OR51F1A6NGY5 319 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 SOD2P04179 222 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 SEC13P55735 322 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 UMPSP11172 480 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 MS4A13Q5J8X5 152 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 AAGABQ6PD74 315 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 SLC17A6Q9P2U8 582 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 CIDEBQ9UHD4 219 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 SNAP91O60641 907 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 GALTP07902 379 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 COPZ1P61923 177 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 SNX20Q7Z614 316 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 CLIP3Q96DZ5 547 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 INSL5Q9Y5Q6 135 aa21.07■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.06■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 A0A087WXM4 84 aa21.06■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 ITGA2P17301 1181 aa21.06■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 IL23RQ5VWK5 629 aa21.06■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 KLHL35Q6PF15 583 aa21.06■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.06■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 NPHS1O60500 1241 aa21.06■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 AMIGO2Q86SJ2 522 aa21.06■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 OR2T12Q8NG77 320 aa21.06■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 KIR3DL1P43629 444 aa21.06■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 IDH2P48735 452 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 BNIP1Q12981 228 aa21.06■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 GSTA3Q16772 222 aa21.06■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 SIRPB2Q5JXA9 342 aa21.06■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 MBLAC2Q68D91 279 aa21.06■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 UNC5BQ8IZJ1 945 aa21.06■□□□□ 0.96
LRP5-201ENST00000294304 OR4A15Q8NGL6 344 aa21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms