RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 DNAJC6O75061 913 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 RASGRP1O95267 797 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 VAPBO95292 243 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 FUCA1P04066 466 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 PRSS56P0CW18 603 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 CARSP49589 748 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 HK3P52790 923 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ITIH4Q14624 930 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 SHBQ15464 509 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 LONRF1Q17RB8 773 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 KCTD16Q68DU8 428 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 DOK6Q6PKX4 331 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 CERS6Q6ZMG9 384 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 UNC5AQ6ZN44 842 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 CEP128Q6ZU80 1094 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 MICALCLQ6ZW33 695 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 SERPINA9Q86WD7 417 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 RELL1Q8IUW5 271 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 LMNTD2Q8IXW0 634 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ZBED8Q8IZ13 594 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 PHACTR4Q8IZ21 702 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 MINDY1Q8N5J2 469 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 GPR150Q8NGU9 434 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 GDAP1Q8TB36 358 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 HEXDCQ8WVB3 486 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 FMO2Q99518 471 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 COPS8Q99627 209 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 TSPYL1Q9H0U9 437 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 FAM96AQ9H5X1 160 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 SAYSD1Q9NPB0 183 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 CATSPERZQ9NTU4 200 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 DNAJC28Q9NX36 388 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ATXN10Q9UBB4 475 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 KLF15Q9UIH9 416 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 PIEZO1Q92508 2521 aa13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 MTX2O75431 263 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ASMTLO95671 621 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 TNFP01375 233 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 JUNDP17535 347 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 OGNP20774 298 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 TNFRSF8P28908 595 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 POLD2P49005 469 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 CCT8P50990 548 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 SEMA3AQ14563 771 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 DBN1Q16643 649 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 TYSND1Q2T9J0 566 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF542PQ5EBM4 170 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 HID1Q8IV36 788 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ANKMY2Q8IV38 441 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 RBFAQ8N0V3 343 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 PYROXD1Q8WU10 500 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 IFT81Q8WYA0 676 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 OR2AG1Q9H205 316 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 IL21RQ9HBE5 538 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 CYP4F12Q9HCS2 524 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ARFGAP3Q9NP61 516 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM9BQ9NQ34 198 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 RXFP3Q9NSD7 469 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 SUFUQ9UMX1 484 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 CFAP99D6REC4 459 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 PCDHGA12O60330 932 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 PIAS2O75928 621 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 CDK14O94921 469 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 RALBP11234 206 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 MSH3P20585 1137 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 AKT1P31749 480 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 NSG1P42857 185 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 TTPAP49638 278 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 B4GALNT1Q00973 533 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 GTF2H3Q13889 308 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms