RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FGL2Q14314 439 aa23.66■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LPGAT1Q92604 370 aa23.66■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AP2M1Q96CW1 435 aa23.66■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SIRPGQ9P1W8 387 aa23.66■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CRLS1Q9UJA2 301 aa23.66■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EMCNQ9ULC0 261 aa23.66■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PSMD11O00231 422 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLIN3O60664 434 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C2P06681 752 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BPGMP07738 259 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C7P10643 843 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BGNP21810 368 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CSRP3P50461 194 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZBTB16Q05516 673 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF460Q14592 562 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 USP10Q14694 798 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GALNT7Q86SF2 657 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLDN23Q96B33 292 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM136AQ96C01 138 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NUS1Q96E22 293 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SIT1Q9Y3P8 196 aa23.65■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TSPAN6O43657 245 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PI15O43692 258 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NDUFS3O75489 264 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SOD1P00441 154 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FMO4P31512 558 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DCDC1P59894 354 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPP2CBP62714 309 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPP2CAP67775 309 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OTOAQ7RTW8 1153 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NUDCD3Q8IVD9 361 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FRMD1Q8N878 549 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TSTD1Q8NFU3 115 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ELMO2Q96JJ3 720 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OLFM1Q99784 485 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLCD4Q9BRC7 762 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TPSD1Q9BZJ3 242 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHRDQ9H2X0 955 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SCML1Q9UN30 329 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa23.64■■□□□ 1.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AGAP14A8MT82 685 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MTX2O75431 263 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PROCP04070 461 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACRV1P26436 265 aa23.63■■□□□ 1.37
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLEC14AQ86T13 490 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CEP97Q8IW35 865 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NXPE1Q8N323 547 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLA2G15Q8NCC3 412 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM216Q9P0N5 145 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TLK1Q9UKI8 766 aa23.63■■□□□ 1.37
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBC1D3EA0A087X179 549 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A0A1W2PQU0 124 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBC1D3LB9A6J9 549 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATG13O75143 517 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBC1D3HP0C7X1 549 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDKN2DP55273 166 aa23.63■■□□□ 1.37
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 USP30Q70CQ3 517 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC63Q8NA47 563 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BIRC8Q96P09 236 aa23.63■■□□□ 1.37
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TSSK1BQ9BXA7 367 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FZD4Q9ULV1 537 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRSS21Q9Y6M0 314 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 INPP4BO15327 924 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TM7SF2O76062 418 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TTPAP49638 278 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 B4GALNT1Q00973 533 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CREB5Q02930 508 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF284Q2VY69 593 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYP2U1Q7Z449 544 aa23.62■■□□□ 1.37
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