RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288607.2

PSMG3-202, Transcript of proteasome assembly chaperone 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSMG3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMG3-202ENST00000288607 B4GAT1O43505 415 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 IFNB1P01574 187 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 ALDH4A1P30038 563 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 B4GALNT1Q00973 533 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 AMZ1Q400G9 498 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 FOXR1Q6PIV2 292 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 OR13C4Q8NGS5 318 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 SLC37A2Q8TED4 501 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 RTP4Q96DX8 246 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 KLC4Q9NSK0 619 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 SLC23A2Q9UGH3 650 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 FKBPLQ9UIM3 349 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 SATB2Q9UPW6 733 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 ZNF148Q9UQR1 794 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 CHUKO15111 745 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 VEGFDO43915 354 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 PPFIA2O75334 1257 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 INSCQ1MX18 579 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 P3H1Q32P28 736 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 ZNF438Q7Z4V0 828 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 PRUNE1Q86TP1 453 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 LRRTM4Q86VH4 590 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 ZNF547Q8IVP9 402 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 LRRC45Q96CN5 670 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 LRRC40Q9H9A6 602 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 ARNT2Q9HBZ2 717 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 EPB41L5Q9HCM4 733 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa24.03■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 GPR89AB7ZAQ6 455 aa24.02■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 AGRPO00253 132 aa24.02■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 PRAMEF1O95521 474 aa24.02■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 GPR89BP0CG08 455 aa24.02■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 ETS1P14921 441 aa24.02■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 TPH1P17752 444 aa24.02■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 STIP1P31948 543 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 CXCR5P32302 372 aa24.02■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 TMPRSS15P98073 1019 aa24.02■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa24.02■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa24.02■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 SFRP1Q8N474 314 aa24.02■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 DTX3LQ8TDB6 740 aa24.02■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 BRSK1Q8TDC3 778 aa24.02■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 DCBLD2Q96PD2 775 aa24.02■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 RDH14Q9HBH5 336 aa24.02■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 PRDM8Q9NQV8 689 aa24.02■■□□□ 1.44
PSMG3-202ENST00000288607 KMOO15229 486 aa24.01■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 CRTAMO95727 393 aa24.01■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 LSSP48449 732 aa24.01■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 INHBCP55103 352 aa24.01■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 ITGA9Q13797 1035 aa24.01■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 GTF2H3Q13889 308 aa24.01■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 NR1D2Q14995 579 aa24.01■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 MAP9Q49MG5 647 aa24.01■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 GPRC6AQ5T6X5 926 aa24.01■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 MICALCLQ6ZW33 695 aa24.01■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 DDHD1Q8NEL9 900 aa24.01■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 GRAMD1AQ96CP6 724 aa24.01■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 TTC25Q96NG3 672 aa24.01■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 A6NCN8 305 aa24■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 CCL22O00626 93 aa24■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 CEP104O60308 925 aa24■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 AP2A1O95782 977 aa24■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 FGGP02679 453 aa24■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 TBC1D25Q3MII6 688 aa24■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 LDLRAP1Q5SW96 308 aa24■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 IYDQ6PHW0 289 aa24■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 USP53Q70EK8 1073 aa24■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 GLIS1Q8NBF1 620 aa24■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 ZNF398Q8TD17 642 aa24■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 ACACAQ13085 2346 aa24■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 CCDC187A0A096LP49 1063 aa23.99■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 LDB2O43679 373 aa23.99■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 SRP72O76094 671 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 F3P13726 295 aa23.99■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 SEPT6Q14141 434 aa23.99■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 POU6F1Q14863 301 aa23.99■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 NKAIN2Q5VXU1 208 aa23.99■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa23.99■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 NAT14Q8WUY8 206 aa23.99■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 NUDT22Q9BRQ3 303 aa23.99■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 KCNF1Q9H3M0 494 aa23.99■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 ASB8Q9H765 288 aa23.99■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 ETNK1Q9HBU6 452 aa23.99■■□□□ 1.43
PSMG3-202ENST00000288607 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms