RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 GPR22Q99680 433 aa15.6■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 ASB8Q9H765 288 aa15.6■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 C7orf72A4D263 438 aa15.6■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 PENKP01210 267 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 RXRGP48443 463 aa15.6■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 SLC11A2P49281 568 aa15.6■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 SULT2A1Q06520 285 aa15.6■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 SPPL2BQ8TCT7 592 aa15.6■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 TRPM4Q8TD43 1214 aa15.6■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 S100ZQ8WXG8 99 aa15.6■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 SERPINB11Q96P15 392 aa15.6■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 CNTN3Q9P232 1028 aa15.6■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa15.6■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 SMIM30A4D0T7 59 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 PLOD2O00469 737 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 VPS4BO75351 444 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 MLYCDO95822 493 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 LCP2Q13094 533 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 ACAP2Q15057 778 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 CRY1Q16526 586 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 TMEM53Q6P2H8 277 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 FAM151BQ6UXP7 276 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 ELOVL7A1L3X0 281 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 VILLO15195 856 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 AIREO43918 545 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 NPHS1O60500 1241 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 SLC35E2BP0CK96 405 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 ZNF549Q6P9A3 640 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 BIRC7Q96CA5 298 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 VPS35Q96QK1 796 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 PLK2Q9NYY3 685 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 AASSQ9UDR5 926 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 BBIP1A8MTZ0 92 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 RGS10O43665 173 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 TBX18O95935 607 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 MC4RP32245 332 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 IFNA8P32881 189 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 C1QTNF8P60827 252 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 DAG1Q14118 895 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 RFX4Q33E94 735 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 TRIQKQ629K1 86 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 LINGO4Q6UY18 593 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 METTL25Q8N6Q8 603 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 STYXQ8WUJ0 223 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 DHRS4Q9BTZ2 278 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 IPPKQ9H8X2 491 aa15.59■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 HLA-DQB2P05538 268 aa15.58■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 ACSM2AQ08AH3 577 aa15.58■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 TSTD2Q5T7W7 516 aa15.58■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 ACSM2BQ68CK6 577 aa15.58■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 GPR180Q86V85 440 aa15.58■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 ZNF696Q9H7X3 374 aa15.58■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 ABCC13Q9NSE7 274 aa15.58■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 CNTNAP1P78357 1384 aa15.58■□□□□ 0.09
USP43-201ENST00000285199 CDC7O00311 574 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 CLPXO76031 633 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 EPN2O95208 641 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 SLC10A7Q0GE19 358 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 FAM187BQ17R55 369 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 UXS1Q8NBZ7 420 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 TOP1MTQ969P6 601 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 FEM1CQ96JP0 617 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 MAGEE1Q9HCI5 957 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 PADI4Q9UM07 663 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 ARVCFO00192 962 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 BEST1O76090 585 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 PIGRP01833 764 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 IFI30P13284 250 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 CD36P16671 472 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 GLUD2P49448 558 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 CLCNKBP51801 687 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 EPS8Q12929 822 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 NPTX1Q15818 432 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 ZFP69Q49AA0 526 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 TRIM69Q86WT6 500 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 BBS7Q8IWZ6 715 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 ATAD1Q8NBU5 361 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 BCO2Q9BYV7 579 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 TRPC4Q9UBN4 977 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.58■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 G3V2L1 256 aa15.57■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 PPP6CO00743 305 aa15.57■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 GRID2O43424 1007 aa15.57■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 WBP4O75554 376 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 DAOAP59103 153 aa15.57■□□□□ 0.08
USP43-201ENST00000285199 CHD4Q14839 1912 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms