RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53B-201ENST00000280780 SLC6A18Q96N87 628 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 CDH19Q9H159 772 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 RAD18Q9NS91 495 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 CATSPERZQ9NTU4 200 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 EURLQ9NYK6 297 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 LGALS13Q9UHV8 139 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 CA5BQ9Y2D0 317 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 PSAT1Q9Y617 370 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 AGAP14A8MT82 685 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 SLC31A1O15431 190 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 WNT1P04628 370 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 HOXD12P35452 270 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 SLC1A2P43004 574 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 CACNG1Q06432 222 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 IRF4Q15306 451 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF470Q6ECI4 717 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF449Q6P9G9 518 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 SNX20Q7Z614 316 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 TRAM1L1Q8N609 369 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF398Q8TD17 642 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 DTX3LQ8TDB6 740 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 ASB12Q8WXK4 309 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 ZBTB9Q96C00 473 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 TLCD1Q96CP7 247 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 SPATA16Q9BXB7 569 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 ASB8Q9H765 288 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 SLC6A14Q9UN76 642 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM53B-201ENST00000280780 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 A0A1B0GTW7 788 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 ENGP17813 658 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 SGCGQ13326 291 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 CTBP1Q13363 440 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 GPR150Q8NGU9 434 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 MYOCQ99972 504 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 PCCBP05166 539 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 ITGALP20701 1170 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 GABRB3P28472 473 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 GCAP28676 217 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 IGFALSP35858 605 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 MPP1Q00013 466 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 LRRC14Q15048 493 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 NLRP8Q86W28 1048 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 CILP2Q8IUL8 1156 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 CEP76Q8TAP6 659 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 CYTH2Q99418 400 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 FAM167BQ9BTA0 163 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 ZFATQ9P243 1243 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 SLC24A2Q9UI40 661 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 A0A1B0GVT2 93 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 CDH16O75309 829 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 GNSP15586 552 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 TYSND1Q2T9J0 566 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 KLHL38Q2WGJ6 581 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF789Q5FWF6 425 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 RAET1GQ6H3X3 334 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 PPM1NQ8N819 430 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 DHRS4Q9BTZ2 278 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 SMOXQ9NWM0 555 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 VPS18Q9P253 973 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 FBXO5Q9UKT4 447 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 A0A1W2PR77 199 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 FAM155BO75949 473 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 DBN1Q16643 649 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 PNCKQ6P2M8 343 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 SERPINA9Q86WD7 417 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 CTAGE3PQ8IX95 158 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 NXPE1Q8N323 547 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 SERAC1Q96JX3 654 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 MCMBPQ9BTE3 642 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 KCTD5Q9NXV2 234 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 TMEM131Q92545 1883 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 S1PR4O95977 384 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 OGNP20774 298 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 DPP6P42658 865 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM53B-201ENST00000280780 ABCG1P45844 678 aa22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms