RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 PAF1Q8N7H5 531 aa16.17■□□□□ 0.18
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SPCS1-201ENST00000233025 COX14Q96I36 57 aa16.17■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa16.17■□□□□ 0.18
SPCS1-201ENST00000233025 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
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SPCS1-201ENST00000233025 AP1S1P61966 158 aa16.14■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 NOMO3P69849 1222 aa16.14■□□□□ 0.17
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SPCS1-201ENST00000233025 TAF3Q5VWG9 929 aa16.14■□□□□ 0.17
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SPCS1-201ENST00000233025 AGAP2Q99490 1192 aa16.14■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 ABCG8Q9H221 673 aa16.14■□□□□ 0.17
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SPCS1-201ENST00000233025 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa16.13■□□□□ 0.17
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SPCS1-201ENST00000233025 UCHL3P15374 230 aa16.13■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 CD1EP15812 388 aa16.13■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 SCNN1BP51168 640 aa16.13■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1CAP62136 330 aa16.13■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 MYBPC3Q14896 1274 aa16.13■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 GPT2Q8TD30 523 aa16.13■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 FAR1Q8WVX9 515 aa16.13■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
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