RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218348.7

USP11-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP11, Length 3,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-201ENST00000218348 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 ART3Q13508 389 aa9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 MMEL1Q495T6 779 aa9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 DNAL1Q4LDG9 190 aa9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 CMTM8Q8IZV2 173 aa9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 NAT16Q8N8M0 369 aa9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 FEM1CQ96JP0 617 aa9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 C3orf30Q96M34 536 aa9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 GBP5Q96PP8 586 aa9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 CDK15Q96Q40 435 aa9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 C17orf80Q9BSJ5 609 aa9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 CEP44Q9C0F1 390 aa9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 VCX3BQ9H321 246 aa9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 VCX3AQ9NNX9 186 aa9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 CDH22Q9UJ99 828 aa9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa9.9□□□□□ -0.82
USP11-201ENST00000218348 ANKRD66B4E2M5 251 aa9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 NVLO15381 856 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 KDELR3O43731 214 aa9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 CRCPO75575 148 aa9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 LINC00032P0C843 101 aa9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 CA5AP35218 305 aa9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 CASP2P42575 452 aa9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 RALGDSQ12967 914 aa9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 KCTD21Q4G0X4 260 aa9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 GAREM2Q75VX8 874 aa9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 CPNE9Q8IYJ1 553 aa9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 DNAJC9Q8WXX5 260 aa9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 VMP1Q96GC9 406 aa9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 FEM1AQ9BSK4 669 aa9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 TTLL2Q9BWV7 592 aa9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 RNF112Q9ULX5 631 aa9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 CCL26Q9Y258 94 aa9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 IRAK3Q9Y616 596 aa9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa9.9□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 E5RI56 91 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 SDHDO14521 159 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 CRTAMO95727 393 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 CD160O95971 181 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 CES1P23141 567 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 DSG1Q02413 1049 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 KIF19Q2TAC6 998 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 KBTBD2Q8IY47 623 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 ZNF366Q8N895 744 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 TSPAN17Q96FV3 270 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 ANKRD27Q96NW4 1050 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 MGME1Q9BQP7 344 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 BOCQ9BWV1 1114 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 SPG21Q9NZD8 308 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 STOML1Q9UBI4 398 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 LZTS1Q9Y250 596 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 MUC3AQ02505 3323 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 TGM5O43548 720 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 TRIM16O95361 564 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 CA3P07451 260 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 STC1P52823 247 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 SH3BP2P78314 561 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 SLC34A1Q06495 639 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 FAM209AQ5JX71 171 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 RFLNAQ6ZTI6 216 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 DSELQ8IZU8 1212 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 NUDT8Q8WV74 236 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 ACOX2Q99424 681 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 HSFX1Q9UBD0 423 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 POMPQ9Y244 141 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 TRAF6Q9Y4K3 522 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 KATNA1O75449 491 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 CXCL14O95715 111 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 ANPEPP15144 967 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 LAG3P18627 525 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 CD70P32970 193 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 BMPR1AP36894 532 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 PIK3CGP48736 1102 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 THOP1P52888 689 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 NTHL1P78549 312 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 PLPP4Q5VZY2 271 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 OR52E8Q6IFG1 317 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 PAOXQ6QHF9 649 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 KIAA0408Q6ZU52 694 aa9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
USP11-201ENST00000218348 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms