RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pik3cgQ9JHG7 1102 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CtsrQ9JIA9 334 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nrg4Q9WTX4 115 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PikfyveQ9Z1T6 2097 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Alpk2Q91ZB0 2144 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smok4aA0JLX3 433 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 L3mbtl1A2A5N8 826 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rhbdl2A2AGA4 302 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Map2k3O09110 347 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fgf10O35565 209 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Limk2O54785 638 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pou5f1P20263 352 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptpn5P54830 541 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcbp1P60335 356 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdh9P70407 786 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd300lgQ1ERP8 331 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vps51Q3UVL4 782 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppm1hQ3UYC0 513 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pnpla1Q3V1D5 599 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kansl1lQ5DTI6 991 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp78Q5U406 512 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fzd6Q61089 709 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fscn1Q61553 493 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tpd52Q62393 224 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lingo3Q6GQU6 589 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gja6Q6S5G4 283 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Maml1Q6T264 1020 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SyncripQ7TMK9 623 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp418Q8BFS8 652 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nup54Q8BTS4 510 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nob1Q8BW10 403 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fmo9Q8C116 539 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 LzicQ8K3C3 190 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ebf4Q8K4J2 599 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TbccQ8VCN9 341 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MiosQ8VE19 875 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Capn8Q91VA3 703 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atoh8Q99NA2 322 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dph2Q9CR25 489 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem135Q9CYV5 458 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hddc3Q9D114 179 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snrnp48Q9D361 337 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr703Q9EPF5 319 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mgea5Q9EQQ9 916 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hipk3Q9ERH7 1192 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PrebQ9WUQ2 417 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3604A0A087WPN2 559 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm4869A0A1B0GSG7 984 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wfdc16A2A5H4 111 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam166bA2AIP0 273 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acnat1A2AKK5 416 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TriqkB2B9E1 86 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spata31E9QAF0 1014 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r67K7N6T2 851 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm8011K7N6Y5 207 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sec22bO08547 215 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrc23O35125 340 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ldb2O55203 373 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eno2P17183 434 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcmt1P23506 227 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gdf5P43027 495 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Brcc3P46737 291 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 WasP70315 520 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hoxb13P70321 286 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PhexP70669 749 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr15Q0VDU3 360 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Esrp1Q3US41 680 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5800Q497L3 186 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SynaQ5G5D5 617 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Magee1Q6PCZ4 918 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1128Q7TR47 311 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr667Q7TRP4 326 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mtmr12Q80TA6 747 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpp38Q80UU2 280 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fstl5Q8BFR2 847 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 D3Ertd751eQ8BGN2 192 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tyw1Q8BJM7 721 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sfr1Q8BP27 319 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr183Q8VFB9 309 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DeraQ91YP3 318 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Srfbp1Q9CZ91 441 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snx29Q9D3S3 818 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ScelQ9EQG3 652 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arih2Q9Z1K6 492 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp4a29A0A087WPC3 509 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttll9A2APC3 461 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aldoart1A6ZI46 419 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mllt6B1AR10 1109 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf518bB2RRE4 1077 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sult2a6B2RVI8 285 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 S100zB9EJL3 99 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp938E9Q9G3 579 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3642K7N6V4 267 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr237-ps1K9J725 310 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1022L7MTT3 315 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aif1O70200 147 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PargO88622 969 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klf10O89091 479 aa6.55□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CfhP06909 1234 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.4 ms