RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc2a5Q9WV38 501 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Alpk2Q91ZB0 2144 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rpl9-ps6A0A140T8T4 192 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 DdcO88533 480 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fpr-rs3O88537 343 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hk1P17710 974 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cct8P42932 548 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 DckP43346 260 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rpl9P51410 192 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf800Q0VEE6 662 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm4951Q3UED7 406 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Esrp1Q3US41 680 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lingo3Q6GQU6 589 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krt72Q6IME9 520 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Maml1Q6T264 1020 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 DglucyQ8BH86 617 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cnpy4Q8BQ47 245 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sept11Q8C1B7 431 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Batf2Q8R1H8 277 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cox18Q8VC74 331 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr677Q8VF06 312 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr183Q8VFB9 309 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem8aQ9ESN3 769 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc7a8Q9QXW9 531 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mad2l1Q9Z1B5 205 aa20.58■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Scn8aQ9WTU3 1978 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fbxl18E9PYR1 771 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm21738J3QP72 227 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn2r57L7N269 863 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hcn4O70507 1186 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Aldh1a1P24549 501 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lhx3P50481 400 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lrrc3P59034 257 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q5EBG8 199 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc6a3Q61327 619 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Defb34Q7TNV8 81 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mib1Q80SY4 1006 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tecpr1Q80VP0 1166 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gtf2a2Q80ZM7 109 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4930503B20RikQ80ZP0 234 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mfn1Q811U4 741 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mab21L3Q8CI17 429 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dclre1cQ8K4J0 705 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zcchc9Q8R1J3 271 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr345Q8VGK4 311 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cdkn2aipnlQ9D211 116 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Efcab1Q9D3N2 212 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tnfsf13Q9D777 241 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NckipsdQ9ESJ4 714 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc194A0A140LIT1 234 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm4869A0A1B0GSG7 984 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp985A2A7A5 519 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn1r3A2AMT7 306 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm3642K7N6V4 267 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gfra2O08842 464 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ncam2O35136 837 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Itgb1P09055 798 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smim24Q0VG18 120 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trmt10cQ3UFY8 414 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nr2c1Q505F1 590 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nfe2l2Q60795 597 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kctd12Q6WVG3 327 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr834Q7TRG8 312 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Snx32Q80ZJ7 404 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ofcc1Q8BGX4 166 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Psd4Q8BLR5 1005 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc9a7Q8BLV3 726 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn1r79Q8R285 306 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem30aQ8VEK0 364 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pcdhga10Q91XY9 930 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nudt7Q99P30 236 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Acer3Q9D099 267 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hddc3Q9D114 179 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ArskQ9D2L1 553 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tnfaip8l2Q9D8Y7 184 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bpifa3Q9D9J8 232 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ScelQ9EQG3 652 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sh3glb1Q9JK48 365 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trpc4Q9QUQ5 974 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 IkbkeQ9R0T8 717 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cldn3Q9Z0G9 219 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tp53bp1P70399 1969 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp626A0A0U1RQ84 676 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnmt3aO88508 908 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Inpp5jP59644 1003 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lrig1P70193 1091 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kpna1Q60960 538 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Otud6aQ6IE21 290 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpbp1l1Q6NZP2 473 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Stmnd1Q6P3A1 279 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Magee1Q6PCZ4 918 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Clec18aQ7TSQ1 534 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 LdahQ8BVA5 326 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rbms3Q8BWL5 431 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Neu4Q8BZL1 478 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sik2Q8CFH6 931 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TwnkQ8CIW5 685 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Epm2aip1Q8VEH5 606 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf639Q99KZ6 485 aa20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.7 ms