RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	IL17B	Q9UHF5	180 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	SYCE3	A1L190	88 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	KCNK1	O00180	336 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ARHGAP6	O43182	974 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	VIP	P01282	170 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	PRKAR1A	P10644	381 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	F3	P13726	295 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	AMD1	P17707	334 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	IL4R	P24394	825 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	POLE2	P56282	527 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	KCNAB2	Q13303	367 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	GTF2H3	Q13889	308 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	SEPT6	Q14141	434 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	GALNT3	Q14435	633 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	IQCB1	Q15051	598 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	QPCT	Q16769	361 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	IYD	Q6PHW0	289 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM71B	Q8TC56	605 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	OR2AG1	Q9H205	316 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	KLC4	Q9NSK0	619 aa		14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
TARDBP-231	ENST00000639599	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	APOL1	O14791	398 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	NUAK1	O60285	661 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	GPR89B	P0CG08	455 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	VCL	P18206	1134 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	ARSE	P51690	589 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	MC2R	Q01718	297 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	FOXM1	Q08050	763 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	MESD	Q14696	234 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	CLCA4	Q14CN2	919 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	PCSK7	Q16549	785 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	GDAP1	Q8TB36	358 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	RTP4	Q96DX8	246 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	TTC25	Q96NG3	672 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	DTL	Q9NZJ0	730 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		14.52	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	SUV39H1	O43463	412 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	AKR1B10	O60218	316 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	RASSF9	O75901	435 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	STK17B	O94768	372 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	EML2	O95834	649 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	PRL	P01236	227 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	KRT1	P04264	644 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	CASP14	P31944	242 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	TAS2R40	P59535	323 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	PDK1	Q15118	436 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	C16orf46	Q6P387	395 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	RFX6	Q8HWS3	928 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	ESX1	Q8N693	406 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	COL26A1	Q96A83	441 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	FAF2	Q96CS3	445 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	AGAP3	Q96P47	875 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	RNF157	Q96PX1	679 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	IFNK	Q9P0W0	207 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		14.51	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		14.5	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	LILRA5	A6NI73	299 aa		14.5	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	KMO	O15229	486 aa		14.5	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	GYPC	P04921	128 aa		14.5	□□□□□ -0.09
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09

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