RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	SLC29A1	Q99808	456 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GLOD4	Q9HC38	313 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SYBU	Q9NX95	663 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ZBBX	A8MT70	800 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TNFRSF10A	O00220	468 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PRRG1	O14668	218 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	DNAJB5	O75953	348 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GJB5	O95377	273 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	KRT75	O95678	551 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CD247	P20963	164 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TACR2	P21452	398 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	DNAJB2	P25686	324 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PSME3	P61289	254 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PRAME	P78395	509 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CRADD	P78560	199 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	OLIG2	Q13516	323 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ANO4	Q32M45	955 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CHSY3	Q70JA7	882 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	FCRL5	Q96RD9	977 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ADA2	Q9NZK5	511 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	BFAR	Q9NZS9	450 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MAFF	Q9ULX9	164 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659		M0QX08	132 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ACSL4	O60488	711 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	USP12	O75317	370 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GMNN	O75496	209 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PRKCG	P05129	697 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ARRB2	P32121	409 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	DPP6	P42658	865 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MAGEA12	P43365	314 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NPY2R	P49146	381 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PRKAA1	Q13131	559 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PLD1	Q13393	1074 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	FATE1	Q969F0	183 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NANOG	Q9H9S0	305 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SMOX	Q9NWM0	555 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	AP3B1	O00203	1094 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM24	O15164	1050 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	COCH	O43405	550 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ANXA9	O76027	345 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SEC14L2	O76054	403 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	FGB	P02675	491 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MPO	P05164	745 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	FCGR1A	P12314	374 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TYK2	P29597	1187 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PPP3CC	P48454	512 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CREM	Q03060	361 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PRKCQ	Q04759	706 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TWF1	Q12792	350 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF773	Q6PK81	442 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	LINC00523	Q86TU6	105 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	LEMD2	Q8NC56	503 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PLD4	Q96BZ4	506 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	HMCES	Q96FZ2	354 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	UBP1	Q9NZI7	540 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PTPRS	Q13332	1948 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		15.21	■□□□□ 0.03

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