RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620722.4

CACNA2D3-212, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-212ENST00000620722 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.96□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.96□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.96□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 C12orf10Q9HB07 376 aa6.96□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZNF302Q9NR11 478 aa6.96□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.96□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.96□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.96□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 NEMP2A6NFY4 417 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 CCDC154A6NI56 674 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 ACKR2O00590 384 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 NCAM2O15394 837 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 PSMD3O43242 534 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 MAN1A2O60476 641 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 USP12O75317 370 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 DLGAP3O95886 979 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 PRKCBP05771 671 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 ARNTP27540 789 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 SLC26A3P40879 764 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 IST1P53990 364 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 TAS2R39P59534 338 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 CDH17Q12864 832 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZNF460Q14592 562 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 POU6F1Q14863 301 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 FAM83EQ2M2I3 478 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 KANK2Q63ZY3 851 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 PAGE2Q7Z2X7 111 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 GALNT7Q86SF2 657 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 METTL4Q8N3J2 472 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 DNAAF3Q8N9W5 541 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 MCFD2Q8NI22 146 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 RNF139Q8WU17 664 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 PROX1Q92786 737 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 LGALS12Q96DT0 336 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 RNF170Q96K19 258 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 FBXL12Q9NXK8 326 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 IL37Q9NZH6 218 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 GBF1Q92538 1859 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 G3V2T6 193 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 CITO14578 2027 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 VPS4BO75351 444 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 PRKD3O94806 890 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 NCK1P16333 377 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 RRM2P31350 389 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 RGS7P49802 495 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 PGGT1BP53609 377 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 NCS1P62166 190 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 POU5F1BQ06416 359 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 PIGFQ07326 219 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 KCNAB2Q13303 367 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 CDK5R2Q13319 367 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 MFSD10Q14728 455 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 CLCA4Q14CN2 919 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 NPTX1Q15818 432 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 KIF19Q2TAC6 998 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZNF404Q494X3 552 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 AADATQ8N5Z0 425 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 DPP10Q8N608 796 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.95□□□□□ -1.3
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CACNA2D3-212ENST00000620722 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 VAT1Q99536 393 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 LRRC3Q9BY71 257 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 SNTG2Q9NY99 539 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D3-212ENST00000620722 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
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