RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.46■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa21.46■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF778Q96MU6 729 aa21.46■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 RANBP9Q96S59 729 aa21.46■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 TREX1Q9NSU2 369 aa21.46■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM74BQ9NUR3 256 aa21.46■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 MID2Q9UJV3 735 aa21.46■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 A0A1W2PP55 124 aa21.45■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 APOA4P06727 396 aa21.45■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 CPA3P15088 417 aa21.45■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 C5AR1P21730 350 aa21.45■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 PARP15Q460N3 678 aa21.45■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 USP30Q70CQ3 517 aa21.45■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 HDDC3Q8N4P3 179 aa21.45■■□□□ 1.02
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SGMS1-210ENST00000619438 NSL1Q96IY1 281 aa21.45■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 FSD1LQ9BXM9 530 aa21.45■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 SGK2Q9HBY8 427 aa21.45■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 PILRBQ9UKJ0 227 aa21.45■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 GON4LQ3T8J9 2241 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 FCHO1O14526 889 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC22O60826 627 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 ZMPSTE24O75844 475 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 SEMA4FO95754 770 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 C2P06681 752 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 C7P10643 843 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 PAMP19021 973 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 CALB2P22676 271 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 MAOBP27338 520 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 SLC1A6P48664 564 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 ARF5P84085 180 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 TCEAL6Q6IPX3 200 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 C10orf107Q8IVU9 208 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 RDH11Q8TC12 318 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 TCEAL3Q969E4 200 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 TADA1Q96BN2 335 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 TNKS2Q9H2K2 1166 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 METTL12A8MUP2 240 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 PATE3B3GLJ2 98 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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SGMS1-210ENST00000619438 WNT3AP56704 352 aa21.44■■□□□ 1.02
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SGMS1-210ENST00000619438 IL10RBQ08334 325 aa21.44■■□□□ 1.02
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SGMS1-210ENST00000619438 TBCCQ15814 346 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM61Q5EBN2 209 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 MARC1Q5VT66 337 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa21.44■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 SNX19Q92543 992 aa21.44■■□□□ 1.02
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SGMS1-210ENST00000619438 CFIP05156 583 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 RALBP11234 206 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 GNSP15586 552 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 SDHBP21912 280 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 KCNA4P22459 653 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 ARNTP27540 789 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 ID4P47928 161 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 MNAT1P51948 309 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 AQP5P55064 265 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 POM121L1PQ3SYA9 428 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 C22orf39Q6P5X5 142 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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SGMS1-210ENST00000619438 OR2A12Q8NGT7 310 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 CEP76Q8TAP6 659 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 NSMCE1Q8WV22 266 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 RMDN1Q96DB5 314 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 CEP44Q9C0F1 390 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 PPM1HQ9ULR3 514 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 ACTL7AQ9Y615 435 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 CAPN14A8MX76 684 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 J3KR12 359 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 HOXD12P35452 270 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 GRM3Q14832 879 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
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