RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 CAB39LQ9H9S4 337 aa16.69■□□□□ 0.26
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TRAPPC3-210ENST00000617904 GTSE1Q9NYZ3 720 aa16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF284Q2VY69 593 aa16.67■□□□□ 0.26
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TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM3CQ92520 227 aa16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM55Q9BYV6 548 aa16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
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TRAPPC3-210ENST00000617904 NEMP1O14524 444 aa16.66■□□□□ 0.26
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TRAPPC3-210ENST00000617904 IL1BP01584 269 aa16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC35E2BP0CK96 405 aa16.66■□□□□ 0.26
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TRAPPC3-210ENST00000617904 PEX6Q13608 980 aa16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP16.66■□□□□ 0.26
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 LMAN1LQ9HAT1 526 aa16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 DLL3Q9NYJ7 618 aa16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM216Q9P0N5 145 aa16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 SIRPGQ9P1W8 387 aa16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 KLHL14Q9P2G3 628 aa16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC3-210ENST00000617904 COPG2Q9UBF2 871 aa16.66■□□□□ 0.26
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