RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 KCTD5Q9NXV2 234 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 SLC23A2Q9UGH3 650 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 ABCA12Q86UK0 2595 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 LILRA5A6NI73 299 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 MAFKO60675 156 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 CLDN7O95471 211 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 CALB1P05937 261 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 FGF5P12034 268 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 PRF1P14222 555 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 TCF4P15884 667 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 AMPD1P23109 780 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 SLC19A1P41440 591 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 RENBPP51606 427 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 STC1P52823 247 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 PEX6Q13608 980 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 LRP8Q14114 963 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF235Q14590 738 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 KCNAB1Q14722 419 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 ERMARDQ5T6L9 678 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 SLC9B2Q86UD5 537 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 PLXDC1Q8IUK5 500 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 RANBP9Q96S59 729 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 SLC25A23Q9BV35 468 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 BRD8Q9H0E9 1235 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 ADGRG1Q9Y653 693 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 DAPK3O43293 454 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 PRLP01236 227 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 CASP14P31944 242 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 HTR7P34969 479 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 GARSP41250 739 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 PTGIRP43119 386 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 PGDP52209 483 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 ARMC12Q5T9G4 340 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 LCN10Q6JVE6 187 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 FAM92BQ6ZTR7 304 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM26Q6ZUK4 368 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 MCOLN2Q8IZK6 566 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 LZTR1Q8N653 840 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 MLKLQ8NB16 471 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 SH3KBP1Q96B97 665 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF599Q96NL3 588 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 PADI1Q9ULC6 663 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 SIK3Q9Y2K2 1263 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 A0A0J9YYE9 177 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 UBXN7O94888 489 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 DDAH2O95865 285 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 TRBC1P01850 177 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 BRAFP15056 766 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 FOLR1P15328 257 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 IL1R2P27930 398 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 MIPP30301 263 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 UGT8Q16880 541 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 TCP11X2Q5H9J9 407 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 USP45Q70EL2 814 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF765Q7L2R6 523 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 NLRP8Q86W28 1048 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 EXD1Q8NHP7 514 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 LRRN4Q8WUT4 740 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 KLHL6Q8WZ60 621 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 HERPUD2Q9BSE4 406 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 NUDT9Q9BW91 350 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 VPS18Q9P253 973 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 ATXN10Q9UBB4 475 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 FBN2P35556 2912 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 A0A0G2JNG1 304 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 A0A1W2PQ67 120 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 KIR2DS3K7RE56 304 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 PSMA2P25787 234 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 MAMLD1Q13495 774 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 IL11RAQ14626 422 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 KIR2DS5Q14953 304 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 NR6A1Q15406 480 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 SLC6A19Q695T7 634 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 FDCSPQ8NFU4 85 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 EID2BQ96D98 161 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 AGPAT1Q99943 283 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 ING2Q9H160 280 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 NT5MQ9NPB1 228 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 KLC4Q9NSK0 619 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 DONSONQ9NYP3 566 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 CHKBQ9Y259 395 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRS-208ENST00000590509 GRID2O43424 1007 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRS-208ENST00000590509 NUAK1O60285 661 aa15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms