RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, human

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTIF-208	ENST00000590422	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	BORA	Q6PGQ7	559 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	IYD	Q6PHW0	289 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	CNTD1	Q8N815	330 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	KCTD6	Q8NC69	237 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	HDAC11	Q96DB2	347 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	RNF31	Q96EP0	1072 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	SPRY4	Q9C004	299 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	DTL	Q9NZJ0	730 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	ARHGAP6	O43182	974 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	SNX2	O60749	519 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	TPM3	P06753	285 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	PIRT	P0C851	137 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	RAB15	P59190	212 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	MC2R	Q01718	297 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	ALS2CL	Q60I27	953 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	NCSTN	Q92542	709 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	RAPGEF5	Q92565	580 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	CEP41	Q9BYV8	373 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	KLHL3	Q9UH77	587 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	AMACR	Q9UHK6	382 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	NKX2-8	O15522	239 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	NUAK1	O60285	661 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	JCHAIN	P01591	159 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	SLC4A1	P02730	911 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	PRKAR1A	P10644	381 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	SFTPC	P11686	197 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	F3	P13726	295 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	CA4	P22748	312 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	CES1	P23141	567 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	GFER	P55789	205 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	TLE1	Q04724	770 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	KCNAB2	Q13303	367 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	PDK2	Q15119	407 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	PLD5	Q8N7P1	536 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	CCNY	Q8ND76	341 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	GPR26	Q8NDV2	337 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	IQCD	Q96DY2	449 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	TRIB3	Q96RU7	358 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	OR2AG1	Q9H205	316 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	OGFR	Q9NZT2	677 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTIF-208	ENST00000590422	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CTIF-208	ENST00000590422	GRID2	O43424	1007 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTIF-208	ENST00000590422	MTX2	O75431	263 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTIF-208	ENST00000590422	STK17B	O94768	372 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTIF-208	ENST00000590422	DLGAP3	O95886	979 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTIF-208	ENST00000590422	MX2	P20592	715 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTIF-208	ENST00000590422	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CTIF-208	ENST00000590422	EPHA4	P54764	986 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTIF-208	ENST00000590422	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CTIF-208	ENST00000590422	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CTIF-208	ENST00000590422	CDC20	Q12834	499 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTIF-208	ENST00000590422	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CTIF-208	ENST00000590422	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTIF-208	ENST00000590422	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CTIF-208	ENST00000590422	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		11.95	□□□□□ -0.5

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