RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588238.1

UBXN6-205, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

Gene UBXN6, Length 4,598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-205ENST00000588238 C1orf50Q9BV19 199 aa14.96□□□□□ -0.01
UBXN6-205ENST00000588238 COPG2Q9UBF2 871 aa14.96□□□□□ -0.01
UBXN6-205ENST00000588238 STK16O75716 305 aa14.96□□□□□ -0.01
UBXN6-205ENST00000588238 KRT36O76013 467 aa14.96□□□□□ -0.01
UBXN6-205ENST00000588238 PSMG1O95456 288 aa14.96□□□□□ -0.01
UBXN6-205ENST00000588238 ATP6V1B2P21281 511 aa14.96□□□□□ -0.01
UBXN6-205ENST00000588238 RPIAP49247 311 aa14.96□□□□□ -0.01
UBXN6-205ENST00000588238 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
UBXN6-205ENST00000588238 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.96□□□□□ -0.01
UBXN6-205ENST00000588238 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
UBXN6-205ENST00000588238 STARD8Q92502 1023 aa14.96□□□□□ -0.01
UBXN6-205ENST00000588238 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.96□□□□□ -0.01
UBXN6-205ENST00000588238 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
UBXN6-205ENST00000588238 PRKG2Q13237 762 aa14.96□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.96□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 DCAF4L2Q8NA75 395 aa14.96□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.96□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 IRF7Q92985 503 aa14.96□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.96□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 A0A0D9SEW6 157 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 VIPP01282 170 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 NSG1P42857 185 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 CUZD1Q86UP6 607 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 PSMD13Q9UNM6 376 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 C2orf78A6NCI8 922 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 WFS1O76024 890 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 SPIDRQ14159 915 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 ZNF460Q14592 562 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 CYP2R1Q6VVX0 501 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 TOX2Q96NM4 488 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 SLC2A13Q96QE2 648 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 PCDH12Q9NPG4 1184 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 KLHL28Q9NXS3 571 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 SCN9AQ15858 1988 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 TM7SF2O76062 418 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 ME2P23368 584 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 PKNOX1P55347 436 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 RING1Q06587 406 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 SLCO2A1Q92959 643 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 DACH2Q96NX9 599 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 NRAPQ86VF7 1730 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 M0QZQ0 153 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 EDF1O60869 148 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 ZMPSTE24O75844 475 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 SLC1A2P43004 574 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 SPOCK2Q92563 424 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 VPS33AQ96AX1 596 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 CCT7Q99832 543 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 DPEP2Q9H4A9 486 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 DZANK1Q9NVP4 752 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 IMPAD1Q9NX62 359 aa14.95□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 WNT9AO14904 365 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 CYP11A1P05108 521 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 HSPA13P48723 471 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 RAB33AQ14088 237 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 PRMT9Q6P2P2 845 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 C3orf58Q8NDZ4 430 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 TK2O00142 265 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 TGM5O43548 720 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 CTSAP10619 480 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 POLD2P49005 469 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 DGKEP52429 567 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 OLIG2Q13516 323 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 SERINC3Q13530 473 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 PWP1Q13610 501 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 PAGE2Q7Z2X7 111 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 ARPINQ7Z6K5 226 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 CYP4X1Q8N118 509 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.94□□□□□ -0.02
UBXN6-205ENST00000588238 BLOC1S6Q9UL45 172 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms