RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583282.5

GGA3-216, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-216	ENST00000583282	TRIM23	P36406	574 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	ELK3	P41970	407 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	GNPDA1	P46926	289 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	POLD2	P49005	469 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	ALG11	Q2TAA5	492 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	HLA-B	Q31612	363 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	CENPU	Q71F23	418 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	HID1	Q8IV36	788 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	ZNF398	Q8TD17	642 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	NAT14	Q8WUY8	206 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	ART4	Q93070	314 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	COX14	Q96I36	57 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-216	ENST00000583282	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282		H7C0S8	307 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	TOR1B	O14657	336 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	RASGRP1	O95267	797 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	VAPB	O95292	243 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	PAM	P19021	973 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	ARNT	P27540	789 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	CCT8	P50990	548 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	PPARD	Q03181	441 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	ACVR1	Q04771	509 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	CACNG1	Q06432	222 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	CRYM	Q14894	314 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	DET1	Q7L5Y6	550 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	SNX20	Q7Z614	316 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	ULK4	Q96C45	1275 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	VPS35	Q96QK1	796 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	OR2AG1	Q9H205	316 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	SMOX	Q9NWM0	555 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	KLF15	Q9UIH9	416 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	SUFU	Q9UMX1	484 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282		H3BM21	787 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	GDF9	O60383	454 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	USP1	O94782	785 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	JUND	P17535	347 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	MSH3	P20585	1137 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	TGM1	P22735	817 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	ACRV1	P26436	265 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	CAV1	Q03135	178 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	GTF2H3	Q13889	308 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	SEMA3A	Q14563	771 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	DBN1	Q16643	649 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	NLRP8	Q86W28	1048 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-216	ENST00000583282	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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