RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 RNF215Q9Y6U7 377 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 FADS2P1A8MWK0 482 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 CASC3O15234 703 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 KCNN4O15554 427 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SNX2O60749 519 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 FTCDO95954 541 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 EPOP01588 193 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 RBP3P10745 1247 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ACP5P13686 325 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PNLIPP16233 465 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 CHRNA4P43681 627 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 LSSP48449 732 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 GEMP55040 296 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 INHBCP55103 352 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 GSDMDP57764 484 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 MPP3Q13368 585 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 LRP8Q14114 963 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 NOMO1Q15155 1222 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SLC14A2Q15849 920 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 KIF26BQ2KJY2 2108 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TBC1D25Q3MII6 688 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 MAP9Q49MG5 647 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF569Q5MCW4 686 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 AADACL2Q6P093 401 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 NRROSQ86YC3 692 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ARL14Q8N4G2 192 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 GPR26Q8NDV2 337 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 GDAP1Q8TB36 358 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TADA1Q96BN2 335 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC45Q96CN5 670 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 COX14Q96I36 57 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TTC25Q96NG3 672 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM74Q96NL1 305 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 WDR24Q96S15 920 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 RMI1Q9H9A7 625 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 THSD1Q9NS62 852 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 VPS18Q9P253 973 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 APPL1Q9UKG1 709 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
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PTPRM-214ENST00000583153 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
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PTPRM-214ENST00000583153 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
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PTPRM-214ENST00000583153 A0A0U1RQJ8 604 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PQM1 296 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
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PTPRM-214ENST00000583153 AURKAO14965 403 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 GRID2O43424 1007 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 BUD23O43709 281 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
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PTPRM-214ENST00000583153 KRT86O43790 486 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ANXA9O76027 345 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TNFSF15O95150 251 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 AGTP01019 485 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TUBB4AP04350 444 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 JMJD7P0C870 316 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 BPIP17213 487 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 HLA-DPA1P20036 260 aa8.24□□□□□ -1.09
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PTPRM-214ENST00000583153 ABCG1P45844 678 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 OR1D5P58170 312 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SLC1A5Q15758 541 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SIRPB2Q5JXA9 342 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PHF19Q5T6S3 580 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 KDELC1Q6UW63 502 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 USP53Q70EK8 1073 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SPRED1Q7Z699 444 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PIM3Q86V86 326 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 JAMLQ86YT9 394 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM139Q8IV31 216 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 NAGSQ8N159 534 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 FBXO39Q8N4B4 442 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TRAM1L1Q8N609 369 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC57Q8N9N7 239 aa8.24□□□□□ -1.09
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