RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570103.5

CFDP1-209, Transcript of craniofacial development protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CFDP1, Length 663 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1-209ENST00000570103 VPS4AQ9UN37 437 aa4.97□□□□□ -1.61
CFDP1-209ENST00000570103 MYO9AB2RTY4 2548 aa4.97□□□□□ -1.61
CFDP1-209ENST00000570103 CKAP5Q14008 2032 aa4.97□□□□□ -1.61
CFDP1-209ENST00000570103 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.97□□□□□ -1.61
CFDP1-209ENST00000570103 ICE1Q9Y2F5 2266 aa4.97□□□□□ -1.61
CFDP1-209ENST00000570103 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.97□□□□□ -1.61
CFDP1-209ENST00000570103 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 HEPACAM2A8MVW5 462 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 QSOX1O00391 747 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 ZNF197O14709 1029 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 TMPRSS11DO60235 418 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 TADA2AO75478 443 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 TJP3O95049 919 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 LARGE1O95461 756 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 NPSP0C0P6 89 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 CD53P19397 219 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 MX1P20591 662 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 OR1D2P34982 312 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 CCR2P41597 374 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 ABCG1P45844 678 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 AVPR1BP47901 424 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 RAE1P78406 368 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 FCHO2Q0JRZ9 810 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 DNASE1L3Q13609 305 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 SLC12A1Q13621 1099 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 ZNF569Q5MCW4 686 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 FAM171A1Q5VUB5 890 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 KIRREL2Q6UWL6 708 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 CYB5R4Q7L1T6 521 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 RHPN2Q8IUC4 686 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 HDDC3Q8N4P3 179 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 PNPLA1Q8N8W4 532 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 CNNM3Q8NE01 707 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 ABHD11Q8NFV4 315 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 PIGKQ92643 395 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 MACROD1Q9BQ69 325 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 SPZ1Q9BXG8 430 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 TRPV4Q9HBA0 871 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 KCNK9Q9NPC2 374 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 SNX15Q9NRS6 342 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 NRBP2Q9NSY0 501 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 GTSE1Q9NYZ3 720 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 FOXJ2Q9P0K8 574 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 PDP2Q9P2J9 529 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 CRYL1Q9Y2S2 319 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 ARHGEF37A1IGU5 675 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 AGAP5A6NIR3 686 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 MGST3O14880 152 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 GALNSP34059 522 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 CCT8P50990 548 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 PRKCEQ02156 737 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 CFHR1Q03591 330 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 FAM187BQ17R55 369 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 PCID2Q5JVF3 399 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 CYP4A22Q5TCH4 519 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 ACSM6Q6P461 480 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 ANKRD16Q6P6B7 361 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 NAPRTQ6XQN6 538 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 NIPA1Q7RTP0 329 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 PLA2G4DQ86XP0 818 aa4.95□□□□□ -1.62
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CFDP1-209ENST00000570103 TMTC1Q8IUR5 882 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 HASPINQ8TF76 798 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 SDCCAG3Q96C92 435 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 NLRP4Q96MN2 994 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 MMS19Q96T76 1030 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 PRDM13Q9H4Q3 707 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 PRORYQ9H606 182 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 TBC1D22BQ9NU19 505 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 CACNG4Q9UBN1 327 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 RCE1Q9Y256 329 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 HES2Q9Y543 173 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa4.95□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 NUMA1Q14980 2115 aa4.94□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 KIF26BQ2KJY2 2108 aa4.94□□□□□ -1.62
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