RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 DUX1O43812 170 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC28A2O43868 658 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 PMPCBO75439 489 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 PYGLP06737 847 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 TPM1P09493 284 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM87AP0C7U9 286 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 THRAP10827 490 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 CES1P23141 567 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPINT3P49223 89 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 LIMK2P53671 638 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPL26P61254 145 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 NFKB2Q00653 900 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 NFATC3Q12968 1075 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRP8Q14114 963 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 NR1D2Q14995 579 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDK1Q15118 436 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 KAZNQ674X7 775 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC9A4Q6AI14 798 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 MFSD7Q6UXD7 560 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 VSTM4Q8IW00 320 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 SFRP1Q8N474 314 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 EXD3Q8N9H8 876 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPR26Q8NDV2 337 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR10G6Q8NH81 332 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCHCR1Q8TD31 782 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 HTR3CQ8WXA8 447 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 NCSTNQ92542 709 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM159Q96B96 161 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 SGF29Q96ES7 293 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC42Q96M95 316 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIB3Q96RU7 358 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC38A3Q99624 504 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 CTRCQ99895 268 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADGRE3Q9BY15 652 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPR63Q9BZJ6 419 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIM4Q9C037 500 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 BPIFA1Q9NP55 256 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRDM8Q9NQV8 689 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLC4Q9NSK0 619 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 VPS18Q9P253 973 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATXN10Q9UBB4 475 aa7.1□□□□□ -1.27
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CCNDBP1-212ENST00000567690 AMACRQ9UHK6 382 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACSL6Q9UKU0 697 aa7.1□□□□□ -1.27
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CCNDBP1-212ENST00000567690 TFR2Q9UP52 801 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPO11Q9Y5K1 396 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 SDK2Q58EX2 2172 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 KALRNO60229 2985 aa7.1□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKRD66B4E2M5 251 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 STMND1H3BQB6 276 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 J3QKU1 62 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 AURKAO14965 403 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPR39O43194 453 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZW10O43264 779 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 GRID2O43424 1007 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 BUD23O43709 281 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 MTA2O94776 668 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 NFKB1P19838 968 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 COMTP21964 271 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTPN3P26045 913 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHRNA4P43681 627 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPR3P46089 330 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 MARCKSL1P49006 195 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP1A2P50993 1020 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARSDP51689 593 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 GSDMDP57764 484 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDK18Q07002 472 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 PEX6Q13608 980 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 INSCQ1MX18 579 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKS6Q68DC2 871 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 NT5DC3Q86UY8 548 aa7.09□□□□□ -1.27
CCNDBP1-212ENST00000567690 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.09□□□□□ -1.27
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