RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 CDKAL1Q5VV42 579 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 DENND2CQ68D51 928 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 KCTD11Q693B1 232 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 AFTPHQ6ULP2 937 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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CAPN3-211ENST00000562199 BIVMQ86UB2 503 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 KIF18BQ86Y91 864 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 RASAL3Q86YV0 1011 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 TBC1D10CQ8IV04 446 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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CAPN3-211ENST00000562199 OR2T34Q8NGX1 318 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 BBS10Q8TAM1 723 aa5.5□□□□□ -1.53
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CAPN3-211ENST00000562199 HDHD2Q9H0R4 259 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 BLZF1Q9H2G9 400 aa5.5□□□□□ -1.53
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CAPN3-211ENST00000562199 TAS2R10Q9NYW0 307 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CRIM1Q9NZV1 1036 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 THEGQ9P2T0 379 aa5.5□□□□□ -1.53
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CAPN3-211ENST00000562199 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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CAPN3-211ENST00000562199 GINS2Q9Y248 185 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 PLCH1Q4KWH8 1693 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 COL18A1P39060 1754 aa5.5□□□□□ -1.53
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CAPN3-211ENST00000562199 GPAA1O43292 621 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 LRRTM2O43300 516 aa5.49□□□□□ -1.53
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CAPN3-211ENST00000562199 FBXO24O75426 580 aa5.49□□□□□ -1.53
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CAPN3-211ENST00000562199 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 PDE8BO95263 885 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 AK1P00568 194 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 TFRCP02786 760 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 MMP1P03956 469 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
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CAPN3-211ENST00000562199 HERVK_113P62684 666 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ERVK-24P63145 666 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SPIBQ01892 262 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 RHAGQ02094 409 aa5.49□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 TTLL4Q14679 1199 aa5.49□□□□□ -1.53
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