RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	KCNH6	Q9H252	994 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	TREX1	Q9NSU2	369 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	SMOX	Q9NWM0	555 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	UBP1	Q9NZI7	540 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	IL17C	Q9P0M4	197 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	5.74	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	NFU1	Q9UMS0	254 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	DMTF1	Q9Y222	760 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF711	Q9Y462	761 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965		A0A1W2PP55	124 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ESYT3	A0FGR9	886 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	AGAP14	A8MT82	685 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965		K7ESF4	209 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	QSOX1	O00391	747 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	WNT9A	O14904	365 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	LAT	O43561	262 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	MAGEC1	O60732	1142 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	SEMA4F	O95754	770 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	GSTM1	P09488	218 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	HOXD12	P35452	270 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	SPAM1	P38567	509 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	MAGEA4	P43358	317 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	POLD2	P49005	469 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	SPINT3	P49223	89 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	TTPA	P49638	278 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	STC1	P52823	247 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	VSNL1	P62760	191 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	FAM193A	P78312	1265 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PRAME	P78395	509 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	GSTM4	Q03013	218 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PLAUR	Q03405	335 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	OVGP1	Q12889	678 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	IHH	Q14623	411 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	NUMA1	Q14980	2115 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	RASA2	Q15283	850 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	LONRF1	Q17RB8	773 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF284	Q2VY69	593 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	COX20	Q5RI15	118 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	LRRC66	Q68CR7	880 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ANO7	Q6IWH7	933 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	CASC4	Q6P4E1	433 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	LIPI	Q6XZB0	460 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	HORMAD1	Q86X24	394 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	TREML1	Q86YW5	311 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	GPR150	Q8NGU9	434 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	HMGB4	Q8WW32	186 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ARRDC3	Q96B67	414 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ULK4	Q96C45	1275 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	DTD2	Q96FN9	168 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	VPS35	Q96QK1	796 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	CCDC77	Q9BR77	488 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	SYBU	Q9NX95	663 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49

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