RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557311.5

ATXN3-247, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-247ENST00000557311 SLC5A2P31639 672 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 DRD3P35462 400 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 TKTL1P51854 596 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 ITGA1P56199 1179 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 SULT2A1Q06520 285 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 DMPKQ09013 629 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 COX10Q12887 443 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 SNX1Q13596 522 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 MORC3Q14149 939 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 TBR1Q16650 682 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 CDKN3Q16667 212 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 LONRF1Q17RB8 773 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 POM121L1PQ3SYA9 428 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 ZACNQ401N2 412 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 VWA3BQ502W6 1294 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 PITRM1Q5JRX3 1037 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 FAM26FQ5R3K3 315 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 CCDC122Q5T0U0 273 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 BSPRYQ5W0U4 402 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 NUGGCQ68CJ6 796 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 VASNQ6EMK4 673 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 SPOPLQ6IQ16 392 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 RFWD3Q6PCD5 774 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 TEPPQ6URK8 271 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 DSG4Q86SJ6 1040 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 NELFCDQ8IXH7 590 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 FBXO39Q8N4B4 442 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 TTC39CQ8N584 583 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 ANKRD52Q8NB46 1076 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 CCDC112Q8NEF3 446 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 WFDC5Q8TCV5 224 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 LZICQ8WZA0 190 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 ARRDC3Q96B67 414 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 LRRC45Q96CN5 670 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 SPAG5Q96R06 1193 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 SYNCQ9H7C4 482 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 L2HGDHQ9H9P8 463 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 LRRC4Q9HBW1 653 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 ABCC13Q9NSE7 274 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 PRELID1Q9Y255 219 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 CA5BQ9Y2D0 317 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 CLIC4Q9Y696 253 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 U3KQA8 63 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 UBE4BO95155 1302 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 ITIH6Q6UXX5 1313 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 MGAQ8IWI9 3026 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 CEP192Q8TEP8 1941 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 TPP1O14773 563 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 PLD2O14939 933 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 NVLO15381 856 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 SGTAO43765 313 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 B3GALNT1O75752 331 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 CYP7B1O75881 506 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 HLA-DRAP01903 254 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 CSF2P04141 144 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 PYGMP11217 842 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 CD58P19256 250 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 SLC6A4P31645 630 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 AKT2P31751 481 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 THBS2P35442 1172 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 CCR10P46092 362 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 GLRBP48167 497 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 SGSHP51688 502 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 RPS24P62847 133 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 TUBA1BP68363 451 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 CNTN1Q12860 1018 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 CUL4BQ13620 913 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 SLC12A1Q13621 1099 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 CDH18Q13634 790 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 TGIF1Q15583 401 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 IGFBP7Q16270 282 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 INAQ16352 499 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 KLHL40Q2TBA0 621 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 CR1LQ2VPA4 569 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 CCDC38Q502W7 563 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 ZNF542PQ5EBM4 170 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 FSCBQ5H9T9 825 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 MANEAQ5SRI9 462 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-247ENST00000557311 PHF19Q5T6S3 580 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms