RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 HERPUD2Q9BSE4 406 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 EFHD1Q9BUP0 239 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ADNPQ9H2P0 1102 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 EPB41L1Q9H4G0 881 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CBX8Q9HC52 389 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 FBXO8Q9NRD0 319 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 RAD18Q9NS91 495 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TMEM9Q9P0T7 183 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 UVRAGQ9P2Y5 699 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TBC1D29Q9UFV1 150 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PRKAB1Q9Y478 270 aa8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 GPR89AB7ZAQ6 455 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ARHGAP6O43182 974 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 NUAK1O60285 661 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 RAD1O60671 282 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 EML2O95834 649 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 HLA-DQB2P05538 268 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 GPR89BP0CG08 455 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ACP5P13686 325 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 F3P13726 295 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 LIFP15018 202 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 KDELR1P24390 212 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PBX1P40424 430 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CD86P42081 329 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 MAPK9P45984 424 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CCR10P46092 362 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ARSDP51689 593 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CLCNKAP51800 687 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 EPHA4P54764 986 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 NFKB2Q00653 900 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 GBE1Q04446 702 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CLCA4Q14CN2 919 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 QPCTQ16769 361 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 KDELC2Q7Z4H8 507 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 LUZP1Q86V48 1076 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PLXDC1Q8IUK5 500 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PQLC3Q8N755 202 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PMEPA1Q969W9 287 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 FAF2Q96CS3 445 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CATSPER2Q96P56 530 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 RNF157Q96PX1 679 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 WDR24Q96S15 920 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CTRCQ99895 268 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 FUCA2Q9BTY2 467 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 SPATA16Q9BXB7 569 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 SPRY4Q9C004 299 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CARD9Q9H257 536 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 KLC4Q9NSK0 619 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 DTLQ9NZJ0 730 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CPNE7Q9UBL6 633 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PILRAQ9UKJ1 303 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 KCNK6Q9Y257 313 aa8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.07□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 LRRD1A4D1F6 860 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 C2orf72A6NCS6 295 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 FADS2P1A8MWK0 482 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 KCNK1O00180 336 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 NKX2-8O15522 239 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TPM3P06753 285 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CASP14P31944 242 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 POLE2P56282 527 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TAS2R40P59535 323 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 MC1RQ01726 317 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 AP1B1Q10567 949 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 KCNAB2Q13303 367 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PDK1Q15118 436 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ODF2Q5BJF6 829 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 NT5DC3Q86UY8 548 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CNTD1Q8N815 330 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 BMPERQ8N8U9 685 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 GPR26Q8NDV2 337 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 OR8K1Q8NGG5 319 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 RAPGEF5Q92565 580 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 HDAC11Q96DB2 347 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 RTP4Q96DX8 246 aa8.06□□□□□ -1.12
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