RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555055.5

XRCC3-211, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene XRCC3, Length 2,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-211ENST00000555055 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.76□□□□□ -0.05
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XRCC3-211ENST00000555055 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
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XRCC3-211ENST00000555055 GEN1Q17RS7 908 aa14.76□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.76□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 PAF1Q8N7H5 531 aa14.76□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
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XRCC3-211ENST00000555055 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
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XRCC3-211ENST00000555055 CCDC160A6NGH7 325 aa14.75□□□□□ -0.05
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XRCC3-211ENST00000555055 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa14.75□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.75□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.75□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.75□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 FATE1Q969F0 183 aa14.75□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 TOP1MTQ969P6 601 aa14.75□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 ZNF558Q96NG5 402 aa14.75□□□□□ -0.05
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XRCC3-211ENST00000555055 TNKS2Q9H2K2 1166 aa14.75□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.75□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 SRP72O76094 671 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
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XRCC3-211ENST00000555055 MC4RP32245 332 aa14.75□□□□□ -0.05
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XRCC3-211ENST00000555055 C5orf22Q49AR2 442 aa14.75□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 LAYNQ6UX15 382 aa14.75□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 CYHR1Q6ZMK1 362 aa14.75□□□□□ -0.05
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XRCC3-211ENST00000555055 BBS5Q8N3I7 341 aa14.75□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 PDZD8Q8NEN9 1154 aa14.75□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 FNDC8Q8TC99 324 aa14.75□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 CCDC167Q9P0B6 97 aa14.75□□□□□ -0.05
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XRCC3-211ENST00000555055 ILVBLA1L0T0 632 aa14.74□□□□□ -0.05
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XRCC3-211ENST00000555055 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
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XRCC3-211ENST00000555055 FAM45AQ8TCE6 357 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 PLD4Q96BZ4 506 aa14.74□□□□□ -0.05
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XRCC3-211ENST00000555055 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 HACD3Q9P035 362 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 MTHFD2P13995 350 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 GFAPP14136 432 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 RHOAP61586 193 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-211ENST00000555055 ACVR1Q04771 509 aa14.74□□□□□ -0.05
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