RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 GSTM1P09488 218 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 JMJD7P0C870 316 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ITIH2P19823 946 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 MSH3P20585 1137 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 LPOP22079 712 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 IDSP22304 550 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ALDH4A1P30038 563 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 FDFT1P37268 417 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SPAM1P38567 509 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ADCY8P40145 1251 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ABCG1P45844 678 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CLCNKAP51800 687 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 WNT3AP56704 352 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SEMG2Q02383 582 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 GSTM4Q03013 218 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNC4Q03721 635 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP4F3Q08477 520 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 NIPAL4Q0D2K0 466 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB17Q13105 803 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 RTP5Q14D33 572 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 LONRF2Q1L5Z9 754 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 INSCQ1MX18 579 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SKIDA1Q1XH10 827 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 PARP6Q2NL67 630 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 MAP9Q49MG5 647 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CERCAMQ5T4B2 595 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 OGFOD3Q6PK18 319 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 DOK6Q6PKX4 331 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC30A9Q6PML9 568 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 NLRP9Q7RTR0 991 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TMC3Q7Z5M5 1100 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRTM4Q86VH4 590 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSWIM9Q86XI8 627 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CCNJLQ8IV13 435 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC35F3Q8IY50 421 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 RBFAQ8N0V3 343 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 PLA2G15Q8NCC3 412 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF248Q8NDW4 579 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR156Q8NFN8 814 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 IPMKQ8NFU5 416 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 MDM1Q8TC05 714 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ACTL9Q8TC94 416 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 OR1E3Q8WZA6 343 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 GLYATL1Q969I3 302 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SPATA13Q96N96 652 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TSSK1BQ9BXA7 367 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 B3GNT4Q9C0J1 378 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM168Q9H0V1 697 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ABCG8Q9H221 673 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 GBA3Q9H227 469 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRN3Q9H3W5 708 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM39Q9HCM9 518 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNK4Q9NYG8 393 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TAAR2Q9P1P5 351 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CD84Q9UIB8 345 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF711Q9Y462 761 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 HYOU1Q9Y4L1 999 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CREBBPQ92793 2442 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM149AA5PLN7 773 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 PLD2O14939 933 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 INPP4BO15327 924 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 DUX1O43812 170 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 NUAK1O60285 661 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 DXOO77932 396 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 PRLP01236 227 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 VIPP01282 170 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC4A1P02730 911 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ITGA2BP08514 1039 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 NFKB1P19838 968 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ITGALP20701 1170 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 LHCGRP22888 699 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CD82P27701 267 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 NDUFS1P28331 727 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 RBL1P28749 1068 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 AKT1P31749 480 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CCKBRP32239 447 aa5.55□□□□□ -1.52
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