RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 GTF2H3Q13889 308 aa11.37□□□□□ -0.59
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UBASH3B-208ENST00000533451 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa11.37□□□□□ -0.59
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UBASH3B-208ENST00000533451 FAM181AQ8N9Y4 354 aa11.37□□□□□ -0.59
UBASH3B-208ENST00000533451 TTC25Q96NG3 672 aa11.37□□□□□ -0.59
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UBASH3B-208ENST00000533451 CHRNA6Q15825 494 aa11.36□□□□□ -0.59
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UBASH3B-208ENST00000533451 NLRP8Q86W28 1048 aa11.36□□□□□ -0.59
UBASH3B-208ENST00000533451 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa11.36□□□□□ -0.59
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UBASH3B-208ENST00000533451 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa11.36□□□□□ -0.59
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UBASH3B-208ENST00000533451 PRAMEF1O95521 474 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-208ENST00000533451 AP2A1O95782 977 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-208ENST00000533451 FUCA1P04066 466 aa11.35□□□□□ -0.59
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UBASH3B-208ENST00000533451 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-208ENST00000533451 KCNJ1P48048 391 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-208ENST00000533451 PDE1BQ01064 536 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-208ENST00000533451 PEX6Q13608 980 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-208ENST00000533451 ITGA9Q13797 1035 aa11.35□□□□□ -0.59
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UBASH3B-208ENST00000533451 INSCQ1MX18 579 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-208ENST00000533451 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-208ENST00000533451 PYCR3Q53H96 274 aa11.35□□□□□ -0.59
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UBASH3B-208ENST00000533451 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
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UBASH3B-208ENST00000533451 COX14Q96I36 57 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-208ENST00000533451 OSBPL9Q96SU4 736 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-208ENST00000533451 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-208ENST00000533451 ETNK1Q9HBU6 452 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-208ENST00000533451 IL26Q9NPH9 171 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-208ENST00000533451 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-208ENST00000533451 IL17CQ9P0M4 197 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-208ENST00000533451 PAK5Q9P286 719 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-208ENST00000533451 ATXN10Q9UBB4 475 aa11.35□□□□□ -0.59
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