RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533012.1

TRAPPC4-211, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-211ENST00000533012 HID1Q8IV36 788 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC4-211ENST00000533012 IFT20Q8IY31 132 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC4-211ENST00000533012 MINDY1Q8N5J2 469 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC4-211ENST00000533012 HEXDCQ8WVB3 486 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC4-211ENST00000533012 IFT81Q8WYA0 676 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC4-211ENST00000533012 UBXN4Q92575 508 aa11.14□□□□□ -0.63
TRAPPC4-211ENST00000533012 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
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TRAPPC4-211ENST00000533012 TREX1Q9NSU2 369 aa11.14□□□□□ -0.63
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TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa11.14□□□□□ -0.63
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TRAPPC4-211ENST00000533012 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZDHHC24Q6UX98 284 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRAPPC4-211ENST00000533012 DDHD1Q8NEL9 900 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRAPPC4-211ENST00000533012 DCUN1D1Q96GG9 259 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRAPPC4-211ENST00000533012 FAM129AQ9BZQ8 928 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRAPPC4-211ENST00000533012 ARFGAP3Q9NP61 516 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC4-211ENST00000533012 TMEM9BQ9NQ34 198 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRAPPC4-211ENST00000533012 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRAPPC4-211ENST00000533012 PRSS38A1L453 326 aa11.12□□□□□ -0.63
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TRAPPC4-211ENST00000533012 CFAP99D6REC4 459 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC4-211ENST00000533012 E7ESA3 106 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC4-211ENST00000533012 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC4-211ENST00000533012 PFDN6O15212 129 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC4-211ENST00000533012 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC4-211ENST00000533012 GPR39O43194 453 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC4-211ENST00000533012 BANF1O75531 89 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC4-211ENST00000533012 IVLP07476 585 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF883P0CG24 379 aa11.12□□□□□ -0.63
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