RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP18.54■□□□□ 0.56
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PTPRK-218ENST00000525459 SRP54P61011 504 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
PTPRK-218ENST00000525459 HLA-BQ31612 363 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRK-218ENST00000525459 TPRG1LQ5T0D9 272 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRK-218ENST00000525459 TCEAL6Q6IPX3 200 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRK-218ENST00000525459 TAS2R42Q7RTR8 314 aa18.52■□□□□ 0.55
PTPRK-218ENST00000525459 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC25Q86WR0 208 aa18.52■□□□□ 0.55
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