RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DENND1BQ6P3S1 775 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q6ZRP5 223 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPAT4Q86UL3 456 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAP7D3Q8IWC1 876 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DCLK2Q8N568 766 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF611Q8N823 705 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HUS1BQ8NHY5 278 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GOLGA1Q92805 767 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYYR1Q96J86 154 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SIN3AQ96ST3 1273 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLX1AQ9BQ83 275 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RTP3Q9BQQ7 232 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC61Q9BV99 259 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HEMGNQ9BXL5 484 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC25A18Q9H1K4 315 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NDST4Q9H3R1 872 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MROH8Q9H579 483 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRPC7Q9HCX4 862 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF186Q9NXI6 227 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAB2Q9NYJ8 693 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GRHPRQ9UBQ7 328 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRWD1Q9UFC0 647 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAN1B1Q9UKM7 699 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CARD8Q9Y2G2 431 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLHL20Q9Y2M5 609 aa0.77□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM129A0AVI4 362 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR5K3A6NET4 321 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM90A26D6RGX4 464 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF197O14709 1029 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDE9AO76083 593 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MTA2O94776 668 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AP2A2O94973 939 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLA2G4BP0C869 781 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EPHA2P29317 976 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HNF4AP41235 474 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTGER3P43115 390 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PGFP49763 221 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NEK3P51956 506 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAD23BP54727 409 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AK2P54819 239 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAPSNQ13702 412 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DECR1Q16698 335 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB6CQ53S08 254 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF766Q5HY98 468 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FRG2Q64ET8 278 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PQLC2Q6ZP29 291 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TICAM1Q8IUC6 712 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC39A11Q8N1S5 342 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF527Q8NB42 609 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR6Y1Q8NGX8 325 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2T11Q8NH01 316 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2L2Q8NH16 312 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRGPRDQ8TDS7 321 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RFT1Q96AA3 541 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PHF21AQ96BD5 680 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC41A2Q96JW4 573 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BBS4Q96RK4 519 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RMDN3Q96TC7 470 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SH3GL2Q99962 352 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM110AQ9BQ89 295 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB6CQ9H0N0 254 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRMDAQ9H2I8 198 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BABAM1Q9NWV8 329 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANAPC11Q9NYG5 84 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTTG2Q9NZH5 202 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIAA1456Q9P272 454 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PEMTQ9UBM1 199 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSPB7Q9UBY9 170 aa0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms