RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 C1orf87Q8N0U7 546 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC38A9Q8NBW4 561 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR1J2Q8NGS2 313 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR5R1Q8NH85 324 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 LMO3Q8TAP4 145 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 THAP6Q8TBB0 222 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 HM13Q8TCT9 377 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 BICD1Q96G01 975 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 DACH2Q96NX9 599 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 DUX5Q96PT3 197 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR1F2PQ96R84 312 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 CMKLR1Q99788 373 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 PIGMQ9H3S5 423 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBTD1Q9HAC8 227 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 SWAP70Q9UH65 585 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 PADI3Q9ULW8 664 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 CGNL1Q0VF96 1302 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 PASKQ96RG2 1323 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1W2PP11 408 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1W2PQ09 198 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR2A25A4D2G3 310 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM8BA6NDV4 472 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAP2K7O14733 419 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 ACOT8O14734 319 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKRD28O15084 1053 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 MITFO75030 526 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMCC2O75069 709 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPC4O75487 556 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 GJB3O75712 270 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 TPPPO94811 219 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 PGM3O95394 542 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 LDHCP07864 332 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLDN20P56880 219 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 TAS2R38P59533 333 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC20A2Q08357 652 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDC16Q13042 620 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHAF1BQ13112 559 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCLAFQ15004 111 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 SYT16Q17RD7 645 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 RILPL1Q5EBL4 403 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 C9orf57Q5W0N0 161 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 C16orf54Q6UWD8 224 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 TPRG1Q6ZUI0 275 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 CREB3L2Q70SY1 520 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 CEP97Q8IW35 865 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 RASGEF1CQ8N431 466 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 ACVR1CQ8NER5 493 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 HMGCLL1Q8TB92 370 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 DUSP19Q8WTR2 217 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 FIG4Q92562 907 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 QRFPRQ96P65 431 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 GAD1Q99259 594 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCYT2Q99447 389 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 GFI1Q99684 422 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 EBF2Q9HAK2 575 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 PAG1Q9NWQ8 432 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 STK39Q9UEW8 545 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 FBXL2Q9UKC9 423 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTPRCP08575 1304 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1B0GUV1 79 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 HS3ST1O14792 307 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC16A5O15375 505 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 LDB3O75112 727 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 TUBBP07437 444 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 HRH2P25021 359 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCKBRP32239 447 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 MSH2P43246 934 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 SUOXP51687 545 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 MFAP4P55083 255 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 RUNX1T1Q06455 604 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNTA1Q13424 505 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRTCAP3Q53RY4 240 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAB6CQ53S08 254 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 Q75L30 129 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM219Q86XT9 240 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 EPHX4Q8IUS5 362 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMTC2Q8N394 836 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 GCSAMQ8N6F7 178 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 POC5Q8NA72 575 aa2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms