RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514275.5

IFT122-231, Transcript of intraflagellar transport 122, human

TSL 5

Gene IFT122, Length 296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT122-231	ENST00000514275	PRAME	P78395	509 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	GNA12	Q03113	381 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	GRIK2	Q13002	908 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	DUSP4	Q13115	394 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	IL23R	Q5VWK5	629 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	KANK2	Q63ZY3	851 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	RNF180	Q86T96	592 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	SPATA24	Q86W54	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	AHI1	Q8N157	1196 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	ANKFN1	Q8N957	763 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	ROPN1L	Q96C74	230 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	ASB9	Q96DX5	294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	B3GALT6	Q96L58	329 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF597	Q96LX8	424 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	PSKH2	Q96QS6	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	ADA2	Q9NZK5	511 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	GALP	Q9UBC7	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	SEPT3	Q9UH03	358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	TMCO1	Q9UM00	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275		F5H5T6	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	ARVCF	O00192	962 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	CDC7	O00311	574 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	STX16	O14662	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	VILL	O15195	856 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	ADAM12	O43184	909 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	TLR5	O60602	858 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	NBN	O60934	754 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	NDUFS3	O75489	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	CLDN11	O75508	207 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	ECI2	O75521	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	TRPA1	O75762	1119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	RHOBTB1	O94844	696 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	GJB5	O95377	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	TSPAN12	O95859	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	TFAP2A	P05549	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT122-231	ENST00000514275	PIRT	P0C851	137 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms