RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511425.5

IFT122-222, Transcript of intraflagellar transport 122, human

TSL 2

Gene IFT122, Length 2,225 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT122-222	ENST00000511425	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	PAX3	P23760	479 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	GSTM2	P28161	218 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	KCNC1	P48547	511 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	LRRC3	Q9BY71	257 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	CCDC154	A6NI56	674 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	SERPINB7	O75635	380 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	SLC22A3	O75751	556 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	GLP2R	O95838	553 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	AKR1A1	P14550	325 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	CTGF	P29279	349 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	BMX	P51813	675 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	EMX2	Q04743	252 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	NEDD8	Q15843	81 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	PCSK7	Q16549	785 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	TTC23	Q5W5X9	447 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	MYLPF	Q96A32	169 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	KIAA1191	Q96A73	305 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	SLC30A3	Q99726	388 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	ACBD6	Q9BR61	282 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	ING2	Q9H160	280 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		13.53	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	FAM234B	A2RU67	622 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425		E9PAM4	449 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425		M0QZ92	97 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	STX16	O14662	325 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	CA12	O43570	354 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	SUPT3H	O75486	399 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	SNAP29	O95721	258 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	MLYCD	O95822	493 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	TH	P07101	528 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	ARSF	P54793	590 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	CDH13	P55290	713 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	CAP1	Q01518	475 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	CLC	Q05315	142 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	BNIP3	Q12983	259 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	DAG1	Q14118	895 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	MARC1	Q5VT66	337 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	ANKS6	Q68DC2	871 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	FAM171B	Q6P995	826 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	DPP10	Q8N608	796 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	TADA1	Q96BN2	335 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	BIRC7	Q96CA5	298 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	ZNF599	Q96NL3	588 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	CHID1	Q9BWS9	393 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	DERL2	Q9GZP9	239 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	MIOS	Q9NXC5	875 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	DSE	Q9UL01	958 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		13.52	□□□□□ -0.24
IFT122-222	ENST00000511425	TTC36	A6NLP5	189 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT122-222	ENST00000511425	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT122-222	ENST00000511425	PEX11B	O96011	259 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT122-222	ENST00000511425	RAP2A	P10114	183 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT122-222	ENST00000511425	UROS	P10746	265 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT122-222	ENST00000511425	ODC1	P11926	461 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT122-222	ENST00000511425	MTHFD2	P13995	350 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT122-222	ENST00000511425	TSPAN8	P19075	237 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT122-222	ENST00000511425	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
IFT122-222	ENST00000511425	ERVK-8	P63133	956 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT122-222	ENST00000511425	GSTM4	Q03013	218 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT122-222	ENST00000511425	TRAF2	Q12933	501 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT122-222	ENST00000511425	NR1D2	Q14995	579 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IFT122-222	ENST00000511425	PFKFB4	Q16877	469 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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