RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504263.1

PCAT4-201, prostate cancer associated transcript 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT4, Length 2,091 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT4-201ENST00000504263 YIPF6Q96EC8 236 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 SGTBQ96EQ0 304 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 ART5Q96L15 291 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 SERPINB11Q96P15 392 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 PNMA5Q96PV4 448 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 MRIQ9BWK5 157 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF416Q9BWM5 594 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 TEKT3Q9BXF9 490 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 ROGDIQ9GZN7 287 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 C20orf27Q9GZN8 174 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 SHARPINQ9H0F6 387 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 DEFB129Q9H1M3 183 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 WDR41Q9HAD4 459 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 TUFT1Q9NNX1 390 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 HPS4Q9NQG7 708 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 PLSCR3Q9NRY6 295 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 RGS18Q9NS28 235 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 MED9Q9NWA0 146 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 FBXL12Q9NXK8 326 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 COA4Q9NYJ1 87 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 TAS2R9Q9NYW1 312 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 EHD3Q9NZN3 535 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 RAB23Q9ULC3 237 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 RNF112Q9ULX5 631 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 CDY1Q9Y6F8 540 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 PLIN4Q96Q06 1357 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 ARAP2Q8WZ64 1704 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 A0A0A6YYJ9 748 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 TMEM82A0PJX8 343 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 CLDN24A6NM45 220 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 DBX1A6NMT0 343 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 GSG1L2A8MUP6 293 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 SLCO1B7G3V0H7 640 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 LINC01387J3KSC0 135 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 MEN1O00255 615 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 STX16O14662 325 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 TSPAN4O14817 238 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 PMM2O15305 246 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 LIASO43766 372 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 ZBTB14O43829 449 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 HS6ST1O60243 411 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 GREM1O60565 184 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 MED24O75448 989 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 RFPL1O75677 317 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 SUPT7LO94864 414 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 GSRP00390 522 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 CHRNA1P02708 482 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 FTH1P02794 183 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 KRT1P04264 644 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 ALPPP05187 535 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 PRKCBP05771 671 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 H2AFB1P0C5Y9 115 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 H2AFB2P0C5Z0 115 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 FDX1P10109 184 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 RRASP10301 218 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 SLC5A1P13866 664 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 NELFEP18615 380 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 CD53P19397 219 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 ITGALP20701 1170 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 ZP3P21754 424 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 TGM2P21980 687 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 PCMT1P22061 227 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 CHMP24386 653 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 NR2F2P24468 414 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 PRKCHP24723 683 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 BMP8BP34820 402 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 YAP1P46937 504 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 STARP49675 285 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 SERPINB9P50453 376 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 NUDT2P50583 147 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 RAB25P57735 213 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 PPP3CAQ08209 521 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 LGALS3BPQ08380 585 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 CDH17Q12864 832 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 EPS8Q12929 822 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 TNFAIP1Q13829 316 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 GRK1Q15835 563 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 AAK1Q2M2I8 961 aa3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PCAT4-201ENST00000504263 RUNDC3AQ59EK9 446 aa3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms