RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 ECEL1O95672 775 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 GLB1P16278 677 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 STIP1P31948 543 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 SPAM1P38567 509 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 CYP4F3Q08477 520 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 CHRNA6Q15825 494 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 KCTD11Q693B1 232 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM151BQ6UXP7 276 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 LRRC45Q96CN5 670 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 RTP4Q96DX8 246 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 DEPDC7Q96QD5 511 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 VPS35Q96QK1 796 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 KCNF1Q9H3M0 494 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 LRIT1Q9P2V4 623 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF148Q9UQR1 794 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 RNF215Q9Y6U7 377 aa16.71■□□□□ 0.27
KCNQ1-205ENST00000496887 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 C2orf81A6NN90 581 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 STX7O15400 261 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 GRID2O43424 1007 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 PPFIA2O75334 1257 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 MTX2O75431 263 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 LPOP22079 712 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 CXCR5P32302 372 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 MAZP56270 477 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 CCL7P80098 99 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 PEX6Q13608 980 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 LRP8Q14114 963 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 P3H1Q32P28 736 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 WDR48Q8TAF3 677 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 BRSK1Q8TDC3 778 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 PATE1Q8WXA2 126 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 LRRC40Q9H9A6 602 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 ARNT2Q9HBZ2 717 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 APPL1Q9UKG1 709 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 KCTD3Q9Y597 815 aa16.7■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 LAMA5O15230 3695 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 GPR39O43194 453 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 CEP104O60308 925 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 UGT1A9O60656 530 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 IFNB1P01574 187 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 FGGP02679 453 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 ACP5P13686 325 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 UGT1A6P19224 532 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 UGT1A1P22309 533 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 UGT1A4P22310 534 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 CA5AP35218 305 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 UGT1A3P35503 534 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 UGT1A5P35504 534 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 ISXQ2M1V0 245 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 PRUNE1Q86TP1 453 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 REXO1L1PQ8IX06 675 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 NAGSQ8N159 534 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 ARL14Q8N4G2 192 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 OR4K2Q8NGD2 314 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 GDAP1Q8TB36 358 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 DTX3LQ8TDB6 740 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 UGT1A7Q9HAW7 530 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 UGT1A10Q9HAW8 530 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 UGT1A8Q9HAW9 530 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 KCNK6Q9Y257 313 aa16.69■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 GPR89AB7ZAQ6 455 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 TAF4O00268 1085 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 CHUKO15111 745 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 PSMD3O43242 534 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 VEGFDO43915 354 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 TCEA3O75764 348 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 CDK14O94921 469 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 CRTAMO95727 393 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 AP2A1O95782 977 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 EML2O95834 649 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 GPR89BP0CG08 455 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 ETS1P14921 441 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 PNLIPP16233 465 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 TPH1P17752 444 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 SPIDRQ14159 915 aa16.68■□□□□ 0.26
KCNQ1-205ENST00000496887 CCNG2Q16589 344 aa16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms