RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495802.5

SKAP2-208, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SKAP2, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-208ENST00000495802 FCGR1AP12314 374 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 PNLIPRP2P54317 469 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 LTBQ06643 244 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 SPOCK1Q08629 439 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 MFSD4BQ5TF39 518 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 LCN10Q6JVE6 187 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 PDXDC1Q6P996 788 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 RHBDF2Q6PJF5 856 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 CCDC190Q86UF4 302 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 AACSQ86V21 672 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 GLCCI1Q86VQ1 547 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 LSMEM1Q8N8F7 131 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 ZNF114Q8NC26 417 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 NEUROG1Q92886 237 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 SCMH1Q96GD3 660 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 CEP295NLQ96MC4 621 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 FIZ1Q96SL8 496 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 CMKLR1Q99788 373 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 SLF1Q9BQI6 1058 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 PADI1Q9ULC6 663 aa4.77□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 LNP1A1A4G5 178 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 FAM90A26D6RGX4 464 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 MID1O15344 667 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 KCNN4O15554 427 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 ADAM20O43506 726 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 KDM4BO94953 1096 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 CLDN14O95500 239 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 UGT1A1P22309 533 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 MMP14P50281 582 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 PEX5P50542 639 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 HSD17B4P51659 736 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 SUOXP51687 545 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 RRP1P56182 461 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 C18orf63Q68DL7 685 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 FAM122CQ6P4D5 195 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 BRAT1Q6PJG6 821 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 MCEMP1Q8IX19 187 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 OR8H2Q8N162 312 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 RASGEF1CQ8N431 466 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 ACVR1CQ8NER5 493 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 SPATA22Q8NHS9 363 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 ERP27Q96DN0 273 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 SERINC2Q96SA4 455 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 PAFAH2Q99487 392 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 TMEM39BQ9GZU3 492 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 IL25Q9H293 177 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 DNAJC18Q9H819 358 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 ZNF224Q9NZL3 707 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 POLG2Q9UHN1 485 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 SIX4Q9UIU6 781 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 FBXL2Q9UKC9 423 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 PLAGL1Q9UM63 463 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 KLHL20Q9Y2M5 609 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 TMEM8BA6NDV4 472 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 GLOD5A6NK44 160 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 ANKRD28O15084 1053 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 P4HA2O15460 535 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 PLPP2O43688 288 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 ADRB2P07550 413 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 LINC00271P0C7V0 271 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 IL11P20809 199 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 KRT20P35900 424 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 STAT2P52630 851 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 CLDN20P56880 219 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 TUBA1BP68363 451 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 TNFAIP1Q13829 316 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 DLG2Q15700 870 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 MYLK3Q32MK0 819 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 BMP2KLQ5H9B9 411 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 KRT79Q5XKE5 535 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 TMCO3Q6UWJ1 677 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 CREB3L2Q70SY1 520 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 GPR180Q86V85 440 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 ADHFE1Q8IWW8 467 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 ZNF34Q8IZ26 560 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 OR5R1Q8NH85 324 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 GSDMBQ8TAX9 411 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 DUSP19Q8WTR2 217 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 TANKQ92844 425 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-208ENST00000495802 PCYT2Q99447 389 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms