RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 LEXMQ3ZCV2 418 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 CTSL3PQ5NE16 218 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 GPR153Q6NV75 609 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 FAM47EQ6ZV65 393 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 HEXDCQ8WVB3 486 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 RAB7BQ96AH8 199 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 FAM136AQ96C01 138 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 GPR78Q96P69 363 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 PITPNM3Q9BZ71 974 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 IGSF5Q9NSI5 407 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 SPINT1O43278 529 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.855e-7■□□□□ 8.4
HOXB3-210ENST00000489475 CA5AP35218 305 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 P2RY2P41231 377 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 SATB1Q01826 763 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 STARD3Q14849 445 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 PCLAFQ15004 111 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 CST6Q15828 149 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 RDH11Q8TC12 318 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 DTX3LQ8TDB6 740 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 KCNJ9Q92806 393 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 GUCD1Q96NT3 240 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 E5RI56 91 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 KLF11O14901 512 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 ADH1BP00325 375 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 CD9P21926 228 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 KCNA4P22459 653 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 ALDH3A1P30838 453 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 CNTN1Q12860 1018 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 CHI3L2Q15782 390 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 ATG16L1Q676U5 607 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM207Q6UWW9 146 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 ANKRD49Q8WVL7 239 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 SCAMP4Q969E2 229 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 GABRG3Q99928 467 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 BOCQ9BWV1 1114 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 SYTL2Q9HCH5 934 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 GNPTGQ9UJJ9 305 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 MED16Q9Y2X0 877 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 WNT9AO14904 365 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 NIPSNAP2O75323 286 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 CHRM3P20309 590 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 ITIH4Q14624 930 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF284Q2VY69 593 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 NRSN1Q8IZ57 195 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 DEFB123Q8N688 67 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 IL17RCQ8NAC3 791 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 COPS8Q99627 209 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 GPR21Q99679 349 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 CKAP5Q14008 2032 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-210ENST00000489475 H3BMM5 538 aa26.58■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 TK2O00142 265 aa26.58■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 NARSO43776 548 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 UGT3A1Q6NUS8 523 aa26.58■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 C10orf107Q8IVU9 208 aa26.58■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 OR2T3Q8NH03 318 aa26.58■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 MSANTD3Q96H12 275 aa26.58■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa26.58■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 XPR1Q9UBH6 696 aa26.58■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 MID1O15344 667 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 MYL2P10916 166 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 C5AR1P21730 350 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 ACAP2Q15057 778 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 CACUL1Q86Y37 369 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 TRAM1L1Q8N609 369 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 FBRSQ9HAH7 460 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 SMOXQ9NWM0 555 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 MYO10Q9HD67 2058 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 G3V2L1 256 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 EDF1O60869 148 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 RBP1P09455 135 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 SRFP11831 508 aa26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms