RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 FKBPLQ9UIM3 349 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 GGT7Q9UJ14 662 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 KCTD3Q9Y597 815 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CCDC162PA2VCL2 907 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 METTL12A8MUP2 240 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 GPR89AB7ZAQ6 455 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 QSOX1O00391 747 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 MAP3K13O43283 966 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PRAMEF1O95521 474 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ACSL3O95573 720 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 GOT2P00505 430 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SLC4A1P02730 911 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 GPR89BP0CG08 455 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 GM2AP17900 193 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ARNTP27540 789 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 FOXN2P32314 431 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 DPP6P42658 865 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ARSDP51689 593 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ADARP55265 1226 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 NFATC2Q13469 925 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PEX6Q13608 980 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ITIH4Q14624 930 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PTPRRQ15256 657 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 LDLRAP1Q5SW96 308 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 LGSNQ5TDP6 509 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 LRIG3Q6UXM1 1119 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 HDXQ7Z353 690 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CENPTQ96BT3 561 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CPNE1Q99829 537 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TMEM109Q9BVC6 243 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SPATA16Q9BXB7 569 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ASB8Q9H765 288 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 VIPAS39Q9H9C1 493 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 BPIFA1Q9NP55 256 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 VPS18Q9P253 973 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TXNDC16Q9P2K2 825 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SLC24A2Q9UI40 661 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 RABGEF1Q9UJ41 708 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ZNF180Q9UJW8 692 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 COMMD10Q9Y6G5 202 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ATG2BQ96BY7 2078 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA8CPA6NN73 597 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 C4orf47A7E2U8 309 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CFAP99D6REC4 459 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 FPGTO14772 594 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ATP8B1O43520 1251 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 BUD23O43709 281 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 RALBP11234 206 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CNTFP26441 200 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TRIM23P36406 574 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PTGER3P43115 390 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 GPR1P46091 355 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 POLD2P49005 469 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SERPINB9P50453 376 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 YPEL5P62699 121 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TMPRSS15P98073 1019 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 OVGP1Q12889 678 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CHRNA6Q15825 494 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TYSND1Q2T9J0 566 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PLK5Q496M5 336 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 GRTP1Q5TC63 336 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SEL1L3Q68CR1 1132 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PNCKQ6P2M8 343 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CES3Q6UWW8 571 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 LPCAT2Q7L5N7 544 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TAOK1Q7L7X3 1001 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TDRPQ86YL5 185 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CILP2Q8IUL8 1156 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 BTN2A2Q8WVV5 523 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD7Q92527 254 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 GPR174Q9BXC1 333 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 EPB41L4BQ9H329 900 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms