RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475912.1

PRKD3-208, Transcript of protein kinase D3, human

TSL 3

Gene PRKD3, Length 760 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC25A27	O95847	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	FCGR1A	P12314	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	CD72	P21854	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	GJC1	P36383	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	CLCN5	P51795	746 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	TRAF3	Q13114	568 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	BIRC3	Q13489	604 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	KCTD2	Q14681	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	NCSTN	Q92542	709 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	IL1A	P01583	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	CKMT1A	P12532	417 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	ACTN1	P12814	892 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	ZNF12	P17014	697 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	CCT5	P48643	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	DEFB103A	P81534	67 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	GPNMB	Q14956	572 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	RMDN1	Q96DB5	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	RIPK3	Q9Y572	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	IL16	Q14005	1332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	PTPRS	Q13332	1948 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912		A0A096LPK6	155 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	MBTPS2	O43462	519 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	HBP1	O60381	514 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	CABYR	O75952	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	BAIAP3	O94812	1187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	GJB5	O95377	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	BAG3	O95817	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	TK1	P04183	234 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	IQCF3	P0C7M6	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	NBL1	P41271	181 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	GAS1	P54826	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	TFCP2	Q12800	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	RPE65	Q16518	533 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	ME3	Q16798	604 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	ARMCX2	Q7L311	632 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKD3-208	ENST00000475912	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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