RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 CHATP28329 748 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 KHKP50053 298 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 HSPB3Q12988 150 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 GALNT17Q6IS24 598 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 DET1Q7L5Y6 550 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 GALNT16Q8N428 558 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A41Q8N5S1 370 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 OR7G3Q8NG95 312 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 DNASE1L2Q92874 299 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 CLMNQ96JQ2 1002 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC3BQ96PB8 259 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 MS4A10Q96PG2 267 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 LHPPQ9H008 270 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 EQTNQ9NQ60 294 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ANO10Q9NW15 660 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 IL19Q9UHD0 177 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 APPL1Q9UKG1 709 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 SNX7Q9UNH6 387 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 SMIM30A4D0T7 59 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM77I1YAP6 450 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 HSPB6O14558 160 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF8O76064 485 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 JTBO76095 146 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 PEX11BO96011 259 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 UROSP10746 265 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TYMPP19971 482 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 IL10P22301 178 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 SOAT1P35610 550 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNJ1P48048 391 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM27E3Q08E93 113 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 LPIN1Q14693 890 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 HFEQ30201 348 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 MYLK3Q32MK0 819 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHL26Q53HC5 615 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TRILQ7L0X0 811 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 KCTD9Q7L273 389 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC190Q86UF4 302 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 SFRP1Q8N474 314 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 SCCPDHQ8NBX0 429 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 HM13Q8TCT9 377 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 EXTL1Q92935 676 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 MIB2Q96AX9 1013 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 REPS1Q96D71 796 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 PKP4Q99569 1192 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 MLST8Q9BVC4 326 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF146Q9NTX7 359 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 STON1Q9Y6Q2 735 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM8BA6NDV4 472 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF103O00237 685 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TOMM70O94826 608 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 CLDN7O95471 211 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ITGB3P05106 788 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 CBSLP0DN79 551 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 BMP7P18075 431 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 DCTDP32321 178 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 CBSP35520 551 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF75DP51815 510 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 LIMK1P53667 647 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 NME5P56597 212 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA1024LP59773 190 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ST8SIA6P61647 398 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 RPS6KA1Q15418 735 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TTC39AQ5SRH9 613 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms