RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470357.1

VAMP3-202, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene VAMP3, Length 954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-202ENST00000470357 BANF1O75531 89 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 KRT38O76015 456 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 TIAF1O95411 115 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 TPH1P17752 444 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 SDHBP21912 280 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 GSTT1P30711 240 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 MSH2P43246 934 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 SLC6A11P48066 632 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 PRAMEP78395 509 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 CRADDP78560 199 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 MGAT5Q09328 741 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 TRAF2Q12933 501 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 DNAJC3Q13217 504 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 GALNT3Q14435 633 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 ZNF234Q14588 700 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 STARD3Q14849 445 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 SLC26A11Q86WA9 606 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 KRT222Q8N1A0 295 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 MPP5Q8N3R9 675 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 TMIEQ8NEW7 156 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 PJA1Q8NG27 643 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 ECHDC3Q96DC8 303 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 MTBPQ96DY7 904 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 LYSMD1Q96S90 227 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 TMEM245Q9H330 911 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 DYRK4Q9NR20 520 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 IL36AQ9UHA7 158 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 LGALS13Q9UHV8 139 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 PPIL1Q9Y3C6 166 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 PKP3Q9Y446 797 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 LAMA5O15230 3695 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 A0A0J9YYE9 177 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 TLDC2A0PJX2 215 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 TSPAN11A1L157 253 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 HMX2A2RU54 273 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 CAPN8A6NHC0 703 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 TTC34A8MYJ7 566 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 TRIM24O15164 1050 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 LDB2O43679 373 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 PRLP01236 227 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 TRBC1P01850 177 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 SHBGP04278 402 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 ZNF30P17039 623 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 FSTP19883 344 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 PSMA3P25788 255 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 HMGCLP35914 325 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 NUMBP49757 651 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 GALK1P51570 392 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 ARHGAP8P85298 464 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 ACVR1Q04771 509 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 FZD5Q13467 585 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 MTM1Q13496 603 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 ENPP2Q13822 863 aa6.62□□□□□ -1.35
VAMP3-202ENST00000470357 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.62□□□□□ -1.35
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